RRP9基因|功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RRP9是核仁小核糖核蛋白复合物的核心组分,参与rRNA加工和核糖体生物发生,其异常表达与多种癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RRP9 |
|---|---|
| 基因全名 | ribosomal RNA processing 9, U3 small nucleolar RNA binding protein |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 3p14.2 |
| NCBI Gene ID | 55808 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55808 |
| Ensembl ID | ENSG00000114771 |
| UniProt ID | Q9H0A9 |
| OMIM ID | 609847 |
| HGNC ID | 29029 |
| 基因别名 | U3-55K, FLJ12770, MGC117215 |
基因功能与研究简介
RRP9(ribosomal RNA processing 9)编码核仁蛋白,是U3小核仁核糖核蛋白(U3 snoRNP)复合物的核心组分。该蛋白参与核糖体RNA(rRNA)的加工和核糖体生物发生,对细胞蛋白质合成至关重要。RRP9在多种癌症中表达异常,可能通过影响核糖体生物发生促进肿瘤发生发展。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症(多种类型) | RRP9在多种癌症中高表达,可能通过促进核糖体生物发生和蛋白质合成,支持肿瘤细胞增殖。 | 较强研究证据 |
| 肝细胞癌 | RRP9在肝细胞癌中表达上调,与不良预后相关,可能通过调控rRNA加工影响肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | RRP9在结直肠癌中表达升高,可能参与肿瘤发生。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 淋巴结 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123A>G (p.Ile41Met) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白功能,但具体影响未知 |
| c.456C>T (p.Pro152Leu) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白稳定性或相互作用 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
暂无明确证据
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003723 (RNA binding) | • GO:0005634 (nucleus) |
| • GO:0005730 (nucleolus) | • GO:0006364 (rRNA processing) |
| • GO:0030515 (snoRNA binding) |
相关通路
• Ribosome biogenesis (Reactome: R-HSA-6791226)
• rRNA processing (Reactome: R-HSA-6791226)
蛋白质功能简介
RRP9蛋白是U3 snoRNP复合物的组成部分,该复合物在核糖体RNA加工中发挥关键作用。RRP9包含一个锌指结构域和多个WD40重复序列,可能参与蛋白质-蛋白质和蛋白质-RNA相互作用。研究表明,RRP9在多种癌细胞中高表达,可能通过促进核糖体生物发生来支持肿瘤生长。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
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