RTCB基因|RNA连接酶功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

RTCB是RNA剪接和tRNA成熟的关键酶,其突变与神经发育障碍相关。

基因信息卡

基因符号 RTCB
基因全名 RNA 2',3'-cyclic phosphate and 5'-OH ligase
基因类型 protein-coding
染色体位置 22q13.2
NCBI Gene ID 146245 ncbi.nlm.nih.gov/gene/146245
Ensembl ID ENSG00000100219
UniProt ID Q9Y3I0
OMIM ID 609909
HGNC ID 26959
基因别名 C22orf28, HSPC117, DJ34B20.2

基因功能与研究简介

RTCB基因编码RNA 2',3'-环磷酸和5'-羟基连接酶,是RNA剪接和tRNA成熟过程中的关键酶。该酶参与tRNA剪接、mRNA加工和RNA修复等过程,对细胞正常功能至关重要。RTCB突变与神经发育障碍相关,但其在癌症中的作用尚在研究中。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 RTCB突变导致RNA连接酶功能缺失,影响tRNA剪接和RNA加工,进而导致神经发育异常。 ClinVar
癌症 RTCB在多种癌症中表达异常,可能通过影响RNA加工参与肿瘤发生,但具体机制尚不明确。 COSMIC

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 中等表达
肝脏 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123A>G (p.I41M) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.456C>T (p.R152*) 无义突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

RTCB突变导致RNA连接酶活性降低或丧失,影响tRNA剪接和RNA加工,导致功能缺失。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明RTCB突变具有功能获得效应。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明RTCB突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003968 (RNA ligase activity) • GO:0006396 (RNA processing)
• GO:0008033 (tRNA processing) • GO:0005634 (nucleus)

相关通路

tRNA splicing pathway (Reactome: R-HSA-6782210)
RNA processing (KEGG: hsa03018)

蛋白质功能简介

RTCB蛋白是RNA连接酶复合物的催化亚基,负责在RNA剪接和tRNA成熟过程中连接RNA片段。该蛋白在细胞核中发挥功能,与多种RNA加工因子相互作用。RTCB的突变可能导致RNA加工异常,进而引发疾病。

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