RTTN基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RTTN基因编码旋转蛋白,参与中心体复制和纤毛形成,其突变与多种纤毛病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RTTN |
|---|---|
| 基因全名 | rotatin |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 18q22.2 |
| NCBI Gene ID | 83696 ncbi.nlm.nih.gov/gene/83696 |
| Ensembl ID | ENSG00000134352 |
| UniProt ID | Q6VWP7 |
| OMIM ID | 610436 |
| HGNC ID | 18654 |
| 基因别名 | FLJ10324, MCPH18 |
基因功能与研究简介
RTTN基因编码旋转蛋白(rotatin),该蛋白在进化上保守,参与中心体复制、纤毛形成和细胞分裂等过程。RTTN突变可导致常染色体隐性遗传性小头畸形-多小脑回综合征(MCPH18)以及伴有多小脑回的短肋胸廓发育不良(SRTD)。研究表明RTTN在神经发育和骨骼发育中发挥重要作用。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 小头畸形-多小脑回综合征-18型(MCPH18) | RTTN基因纯合或复合杂合突变导致蛋白功能缺失,影响中心体复制和神经祖细胞增殖,导致小头畸形和多小脑回。 | 已明确致病(OMIM) |
| 伴有多小脑回的短肋胸廓发育不良(SRTD) | RTTN突变导致纤毛形成异常,影响骨骼发育,表现为短肋、胸廓狭窄和多小脑回。 | 已明确致病(OMIM) |
| 原发性纤毛运动障碍(PCD) | RTTN突变可能影响纤毛运动,但证据有限,需进一步研究。 | 潜在关联(ClinVar) |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达(GTEx) |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 中等表达(GTEx) |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达(GTEx) |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 中等表达(GTEx) |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用于过表达研究 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用于细胞周期研究 |
| U2OS | 暂无可靠数据 | 常用于纤毛研究 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.2386C>T (p.Arg796Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白截短 |
| c.5470C>T (p.Arg1824Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,需功能验证 |
| c.1000delA (p.Thr334ProfsTer5) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白截短 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):RTTN突变导致蛋白功能丧失,是MCPH18和SRTD的主要致病机制。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明RTTN突变具有功能获得效应。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):目前暂无明确证据表明RTTN突变具有显性负性效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005813 (centrosome) | • GO:0005929 (cilium) |
| • GO:0007049 (cell cycle) | • GO:0005515 (protein binding) |
相关通路
• Cilium Assembly (GO:0060271)
• Centrosome Cycle (GO:0007098)
蛋白质功能简介
旋转蛋白(rotatin)由RTTN基因编码,包含多个WD40重复结构域,参与中心体复制和纤毛形成。该蛋白在细胞分裂中定位于中心体,调节中心体数目和完整性。在纤毛形成中,RTTN参与基体成熟和纤毛组装。RTTN功能缺失导致中心体异常和纤毛缺陷,进而引发神经发育和骨骼发育异常。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
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