RUBCNL基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RUBCNL(RUN and cysteine-rich domain containing beclin-1 interacting protein like)是自噬调控因子,参与自噬体形成,与神经退行性疾病和癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RUBCNL |
|---|---|
| 基因全名 | RUN and cysteine-rich domain containing beclin-1 interacting protein like |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 13q14.2 |
| NCBI Gene ID | 100506658 ncbi.nlm.nih.gov/gene/100506658 |
| Ensembl ID | ENSG00000214944 |
| UniProt ID | Q5T6F2 |
| OMIM ID | 暂无可靠数据 |
| HGNC ID | HGNC:37225 |
| 基因别名 | C13orf18, FLJ32658 |
基因功能与研究简介
RUBCNL(RUN and cysteine-rich domain containing beclin-1 interacting protein like)是自噬调控因子,与RUBCN(RUN domain and cysteine-rich domain containing, Beclin 1-interacting protein)同源,参与自噬体形成。RUBCNL与Beclin 1相互作用,调节自噬活性,影响细胞稳态。研究表明,RUBCNL在神经退行性疾病和癌症中表达异常,可能通过调控自噬影响疾病进程。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 阿尔茨海默病 | RUBCNL可能通过调控自噬影响β-淀粉样蛋白的清除,与阿尔茨海默病相关。 | 研究证据:表达水平改变,但因果关系未明确。 |
| 帕金森病 | RUBCNL参与自噬调控,可能影响α-突触核蛋白的降解,与帕金森病相关。 | 研究证据:表达水平改变,但因果关系未明确。 |
| 肝细胞癌 | RUBCNL在肝细胞癌中表达上调,可能通过促进自噬促进肿瘤生长。 | 研究证据:表达水平改变,但因果关系未明确。 |
| 乳腺癌 | RUBCNL在乳腺癌中表达异常,可能通过自噬影响肿瘤进展。 | 研究证据:表达水平改变,但因果关系未明确。 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| 暂无明确致病突变 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变:导致RUBCNL蛋白功能丧失,可能影响自噬过程,但具体疾病关联尚不明确。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变:可能导致自噬过度激活,但具体疾病关联尚不明确。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变:可能干扰正常RUBCNL功能,但具体疾病关联尚不明确。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0006914 (autophagy) | • GO:0005776 (autophagosome) |
| • GO:0016020 (membrane) | • GO:0005515 (protein binding) |
相关通路
• Autophagy - animal (KEGG: hsa04140)
蛋白质功能简介
RUBCNL蛋白包含RUN结构域和富含半胱氨酸的结构域,与Beclin 1相互作用,参与自噬体形成。该蛋白可能作为支架蛋白,调节自噬相关蛋白复合物的组装。在细胞中,RUBCNL定位于自噬体膜,调控自噬通量。