RUFY1基因|基因功能、疾病关联、突变与细胞模型研究

RUFY1编码RUN和FYVE结构域蛋白1,参与内体运输和自噬调控,与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 RUFY1
基因全名 RUN and FYVE domain containing 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 5q35.3
NCBI Gene ID 80230 ncbi.nlm.nih.gov/gene/80230
Ensembl ID ENSG00000113520
UniProt ID Q96T51
OMIM ID 610510
HGNC ID 19757
基因别名 ZFYVE12, PPP1R139, RUFY1

基因功能与研究简介

RUFY1(RUN and FYVE domain containing 1)基因编码一个含有RUN结构域和FYVE结构域的蛋白质。该蛋白定位于早期内体,参与内体运输、自噬调控和细胞信号转导。RUFY1通过与磷脂酰肌醇3-磷酸(PI3P)结合,调控内体融合和分选。研究表明,RUFY1在神经系统中高表达,可能参与突触囊泡循环和神经退行性疾病的病理过程。此外,RUFY1在多种癌症中表达异常,与肿瘤发生发展相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
帕金森病 RUFY1参与自噬调控,其功能异常可能导致α-突触核蛋白清除障碍,与帕金森病发病相关。 较强研究证据
肝细胞癌 RUFY1在肝细胞癌中表达上调,可能通过促进内体运输和自噬促进肿瘤细胞增殖和转移。 癌症相关
阿尔茨海默病 RUFY1参与内体运输,可能影响淀粉样前体蛋白的加工,与阿尔茨海默病相关。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.567C>T (p.Arg189Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变:导致RUFY1蛋白功能丧失或降低,可能影响内体运输和自噬,与疾病发生相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:增强RUFY1蛋白活性,可能促进肿瘤细胞增殖和转移。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:突变蛋白干扰正常RUFY1功能,导致细胞功能异常。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005768 (endosome) • GO:0005545 (phosphatidylinositol-3-phosphate binding)
• GO:0006914 (autophagy) • GO:0016192 (vesicle-mediated transport)

相关通路

Autophagy - animal (KEGG: hsa04140)
Endocytosis (KEGG: hsa04144)

蛋白质功能简介

RUFY1蛋白包含RUN结构域和FYVE结构域,定位于早期内体。RUN结构域参与蛋白-蛋白相互作用,FYVE结构域特异性结合磷脂酰肌醇3-磷酸(PI3P),介导蛋白在内体膜上的募集。RUFY1通过调控内体融合和分选,参与自噬、受体回收和信号转导。在神经系统中,RUFY1可能调节突触囊泡循环,其功能异常与神经退行性疾病相关。在癌症中,RUFY1表达异常可能影响肿瘤微环境和肿瘤进展。

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