RUFY3基因|基因功能、疾病关联、突变与细胞模型研究

RUFY3是调控细胞自噬和神经元极性关键蛋白,与多种癌症和神经发育相关。

基因信息卡

基因符号 RUFY3
基因全名 RUN and FYVE domain containing 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 4q21.1
NCBI Gene ID 22902 ncbi.nlm.nih.gov/gene/22902
Ensembl ID ENSG00000138668
UniProt ID Q7L099
OMIM ID 611194
HGNC ID 20763
基因别名 KIAA0871, ZFYVE31

基因功能与研究简介

RUFY3(RUN and FYVE domain containing 3)编码一个含有RUN和FYVE结构域的蛋白质,参与调控细胞自噬、内体运输和神经元极性。该基因在多种组织中表达,尤其在脑和肿瘤组织中高表达。研究表明RUFY3在癌症进展和神经发育中发挥重要作用,可能作为潜在的治疗靶点。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肝细胞癌 RUFY3在肝细胞癌中高表达,通过促进自噬和细胞迁移参与肿瘤进展。 较强研究证据
结直肠癌 RUFY3在结直肠癌中表达上调,与肿瘤侵袭和不良预后相关。 较强研究证据
神经发育障碍 RUFY3参与神经元极性建立,其异常可能与神经发育障碍相关。 潜在关联
胃癌 RUFY3在胃癌中高表达,可能通过调控自噬影响肿瘤生长。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
肝脏 暂无可靠数据 中等表达
结肠 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.567delC (p.Leu190Trpfs*23) 移码突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如移码突变导致蛋白截短,可能影响自噬调控。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变,如某些错义突变可能增强蛋白活性,促进肿瘤进展。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变,可能干扰正常蛋白功能,但证据不足。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005768 endosome
• GO:0006914 autophagy • GO:0005737 cytoplasm
• GO:0030030 cell projection organization

相关通路

Autophagy - animal (KEGG: hsa04140)
Endocytosis (KEGG: hsa04144)

蛋白质功能简介

RUFY3蛋白包含RUN结构域和FYVE结构域,定位于早期内体,参与自噬体形成和内体运输。在神经元中,RUFY3调控轴突生长和极性建立。在肿瘤细胞中,RUFY3通过促进自噬和细胞迁移影响肿瘤进展。

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