RUNX1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

RUNX1是造血发育的关键转录因子,其突变与急性髓系白血病及家族性血小板疾病密切相关。

基因信息卡

基因符号 RUNX1
基因全名 RUNX1, RUNX Family Transcription Factor 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 21q22.12
NCBI Gene ID 861 ncbi.nlm.nih.gov/gene/861
Ensembl ID ENSG00000159216
UniProt ID Q01196
OMIM ID 601399
HGNC ID 10471
基因别名 AML1, CBFA2, PEBP2A2, AML1-EVI-1

基因功能与研究简介

RUNX1(RUNX家族转录因子1)是造血发育的关键转录因子,属于RUNX家族,与CBFB形成异二聚体,调控造血干细胞的生成和分化。RUNX1通过结合DNA上的共有序列,激活或抑制靶基因的转录,参与造血、血管生成、神经发育等过程。RUNX1突变与多种血液系统疾病相关,包括急性髓系白血病(AML)、骨髓增生异常综合征(MDS)以及家族性血小板疾病伴髓系恶性肿瘤(FPDMM)。此外,RUNX1在实体瘤中也存在异常表达,但其作用机制尚在研究中。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
急性髓系白血病(AML) RUNX1突变(包括点突变、缺失、易位)导致功能丧失或显性负效应,影响造血分化,促进白血病发生。 已明确致病
骨髓增生异常综合征(MDS) RUNX1突变与MDS的发生和进展相关,可能通过影响造血干/祖细胞的分化。 已明确致病
家族性血小板疾病伴髓系恶性肿瘤(FPDMM) RUNX1胚系突变导致血小板减少和功能异常,并显著增加AML/MDS风险。 已明确致病
T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL) RUNX1突变或异常表达在T-ALL中观察到,可能参与疾病发生。 具有较强研究证据
实体瘤 RUNX1在乳腺癌、肺癌等实体瘤中表达异常,可能通过调控细胞增殖和凋亡参与肿瘤进展。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
骨髓 暂无可靠数据 高表达
胸腺 暂无可靠数据 中等表达
脾脏 暂无可靠数据 中等表达
外周血 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
K562 暂无可靠数据 慢性髓系白血病细胞系
HL-60 暂无可靠数据 急性髓系白血病细胞系
Jurkat 暂无可靠数据 T细胞白血病细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚胎肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
RUNX1-RUNX1T1融合 染色体易位 t(8;21) 常见于AML M2亚型 产生融合蛋白,显性负效应,抑制RUNX1靶基因转录
p.Arg139Gln 错义突变 罕见 影响DNA结合域,导致功能丧失
p.Arg166Lys 错义突变 罕见 影响Runt同源结构域,可能改变DNA结合能力
p.Leu472Ser 错义突变 罕见 影响转录激活域,导致功能丧失
移码突变 插入/缺失 罕见 导致截短蛋白,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如无义突变、移码突变、部分错义突变,导致RUNX1蛋白表达减少或功能缺失,影响造血分化。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变,如RUNX1-RUNX1T1融合蛋白,获得异常转录调控功能,抑制分化并促进增殖。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负效应突变,如某些错义突变或截短突变,突变蛋白干扰野生型RUNX1的功能,抑制靶基因转录。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0000978 - RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001228 - DNA-binding transcription activator activity
• RNA polymerase II-specific • GO:0005634 - nucleus
• GO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0030097 - hemopoiesis
• GO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II

相关通路

hsa05202 - Transcriptional misregulation in cancer
hsa05200 - Pathways in cancer
hsa04630 - JAK-STAT signaling pathway
hsa04064 - NF-kappa B signaling pathway

蛋白质功能简介

RUNX1蛋白由480个氨基酸组成,包含N端的Runt同源结构域(RHD),负责与DNA结合和CBFB异二聚化;C端富含脯氨酸/丝氨酸/苏氨酸的转录激活域(TAD)和抑制域。RUNX1作为转录因子,通过结合靶基因启动子或增强子,调控造血相关基因的表达。RUNX1在造血干细胞生成、分化及血小板形成中发挥关键作用。RUNX1突变或融合蛋白导致功能异常,是多种血液恶性肿瘤的驱动因素。

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