RUNX1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RUNX1是造血发育的关键转录因子,其突变与急性髓系白血病及家族性血小板疾病密切相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RUNX1 |
|---|---|
| 基因全名 | RUNX1, RUNX Family Transcription Factor 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 21q22.12 |
| NCBI Gene ID | 861 ncbi.nlm.nih.gov/gene/861 |
| Ensembl ID | ENSG00000159216 |
| UniProt ID | Q01196 |
| OMIM ID | 601399 |
| HGNC ID | 10471 |
| 基因别名 | AML1, CBFA2, PEBP2A2, AML1-EVI-1 |
基因功能与研究简介
RUNX1(RUNX家族转录因子1)是造血发育的关键转录因子,属于RUNX家族,与CBFB形成异二聚体,调控造血干细胞的生成和分化。RUNX1通过结合DNA上的共有序列,激活或抑制靶基因的转录,参与造血、血管生成、神经发育等过程。RUNX1突变与多种血液系统疾病相关,包括急性髓系白血病(AML)、骨髓增生异常综合征(MDS)以及家族性血小板疾病伴髓系恶性肿瘤(FPDMM)。此外,RUNX1在实体瘤中也存在异常表达,但其作用机制尚在研究中。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 急性髓系白血病(AML) | RUNX1突变(包括点突变、缺失、易位)导致功能丧失或显性负效应,影响造血分化,促进白血病发生。 | 已明确致病 |
| 骨髓增生异常综合征(MDS) | RUNX1突变与MDS的发生和进展相关,可能通过影响造血干/祖细胞的分化。 | 已明确致病 |
| 家族性血小板疾病伴髓系恶性肿瘤(FPDMM) | RUNX1胚系突变导致血小板减少和功能异常,并显著增加AML/MDS风险。 | 已明确致病 |
| T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL) | RUNX1突变或异常表达在T-ALL中观察到,可能参与疾病发生。 | 具有较强研究证据 |
| 实体瘤 | RUNX1在乳腺癌、肺癌等实体瘤中表达异常,可能通过调控细胞增殖和凋亡参与肿瘤进展。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 胸腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 外周血 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| K562 | 暂无可靠数据 | 慢性髓系白血病细胞系 |
| HL-60 | 暂无可靠数据 | 急性髓系白血病细胞系 |
| Jurkat | 暂无可靠数据 | T细胞白血病细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚胎肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| RUNX1-RUNX1T1融合 | 染色体易位 t(8;21) | 常见于AML M2亚型 | 产生融合蛋白,显性负效应,抑制RUNX1靶基因转录 |
| p.Arg139Gln | 错义突变 | 罕见 | 影响DNA结合域,导致功能丧失 |
| p.Arg166Lys | 错义突变 | 罕见 | 影响Runt同源结构域,可能改变DNA结合能力 |
| p.Leu472Ser | 错义突变 | 罕见 | 影响转录激活域,导致功能丧失 |
| 移码突变 | 插入/缺失 | 罕见 | 导致截短蛋白,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,如无义突变、移码突变、部分错义突变,导致RUNX1蛋白表达减少或功能缺失,影响造血分化。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变,如RUNX1-RUNX1T1融合蛋白,获得异常转录调控功能,抑制分化并促进增殖。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负效应突变,如某些错义突变或截短突变,突变蛋白干扰野生型RUNX1的功能,抑制靶基因转录。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0000978 - RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding | • GO:0001228 - DNA-binding transcription activator activity |
| • RNA polymerase II-specific | • GO:0005634 - nucleus |
| • GO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II | • GO:0030097 - hemopoiesis |
| • GO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II |
相关通路
• hsa05202 - Transcriptional misregulation in cancer
• hsa05200 - Pathways in cancer
• hsa04630 - JAK-STAT signaling pathway
• hsa04064 - NF-kappa B signaling pathway
蛋白质功能简介
RUNX1蛋白由480个氨基酸组成,包含N端的Runt同源结构域(RHD),负责与DNA结合和CBFB异二聚化;C端富含脯氨酸/丝氨酸/苏氨酸的转录激活域(TAD)和抑制域。RUNX1作为转录因子,通过结合靶基因启动子或增强子,调控造血相关基因的表达。RUNX1在造血干细胞生成、分化及血小板形成中发挥关键作用。RUNX1突变或融合蛋白导致功能异常,是多种血液恶性肿瘤的驱动因素。
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