RUNX1T1基因｜基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RUNX1T1是急性髓系白血病中常见的融合基因伙伴，参与造血调控和白血病发生。
基因信息卡
| 基因符号 | RUNX1T1 |
|---|---|
| 基因全名 | RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 8q21.3 |
| NCBI Gene ID | 862 ncbi.nlm.nih.gov/gene/862 |
| Ensembl ID | ENSG00000101115 |
| UniProt ID | Q06455 |
| OMIM ID | 133435 |
| HGNC ID | 10480 |
| 基因别名 | ETO, MTG8, AML1T1, CBFA2T1, ZMYND3 |
基因功能与研究简介
RUNX1T1（RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1）基因编码一个转录共抑制因子，属于MYND结构域蛋白家族。该蛋白通过与RUNX1（AML1）相互作用，参与造血干细胞的分化和发育调控。RUNX1T1在正常造血中发挥重要作用，其异常表达或融合（如t(8;21)易位产生的RUNX1-RUNX1T1融合蛋白）是急性髓系白血病（AML）的常见致病因素。RUNX1T1还参与其他细胞过程，如细胞周期调控和凋亡。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 急性髓系白血病（AML） | RUNX1T1与RUNX1形成融合基因RUNX1-RUNX1T1，该融合蛋白异常抑制RUNX1靶基因的转录，导致造血分化阻滞和白血病发生。 | 已明确致病 |
| 骨髓增生异常综合征（MDS） | RUNX1T1的异常表达或突变可能参与MDS的发病，但证据尚不充分。 | 潜在关联 |
| 实体瘤 | RUNX1T1在部分实体瘤中表达异常，但具体作用机制尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 高表达于造血组织 |
| 外周血 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| Kasumi-1 | 暂无可靠数据 | AML细胞系，携带t(8;21)易位 |
| SKNO-1 | 暂无可靠数据 | AML细胞系，携带t(8;21)易位 |
| HEL | 暂无可靠数据 | 红白血病细胞系，RUNX1T1表达较低 |
数据来源：Human Protein Atlas（proteinatlas.org）
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| t(8;21)(q22;q22) | 染色体易位 | 常见于AML（约10-15%） | 产生RUNX1-RUNX1T1融合蛋白，功能获得（Gain of Function） |
| RUNX1T1点突变 | 错义突变 | 罕见 | 功能影响尚不明确，可能影响蛋白稳定性或相互作用 |
突变功能分类
Loss of Function（功能缺失，LOF）
RUNX1T1的纯合缺失或失活突变可能导致功能丧失，但目前在疾病中较少见。
Gain of Function（功能获得，GOF）
RUNX1-RUNX1T1融合蛋白是典型的功能获得突变，获得新的转录抑制功能，导致造血分化阻滞。
Dominant Negative（显性负效应，DN）
RUNX1-RUNX1T1融合蛋白可能通过竞争性结合RUNX1靶基因，发挥显性负效应，抑制正常RUNX1功能。
查看完整突变数据：
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003714 transcription corepressor activity | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0006355 regulation of transcription | • DNA-templated |
| • GO:0000122 negative regulation of transcription by RNA polymerase II | • GO:0030154 cell differentiation |
相关通路
• Pathway: RUNX1-RUNX1T1 fusion in AML (KEGG: hsa05221)
• Pathway: Transcriptional regulation by RUNX1 (Reactome: R-HSA-8939243)
蛋白质功能简介
RUNX1T1蛋白（又称ETO）包含一个N端TBP相关因子结合域和一个C端MYND结构域，后者介导与组蛋白去乙酰化酶（HDAC）等共抑制复合物的相互作用。RUNX1T1通过与RUNX1结合，抑制RUNX1靶基因的转录，从而调控造血细胞的分化。在t(8;21)易位中，RUNX1T1的N端部分与RUNX1的DNA结合域融合，形成RUNX1-RUNX1T1融合蛋白，该融合蛋白异常招募HDAC复合物，导致RUNX1靶基因的异常沉默，是AML发病的关键机制。
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