RUNX2基因|基因功能、疾病关联、突变与骨发育研究

RUNX2是成骨细胞分化和骨骼发育的关键转录因子,其突变可导致颅骨锁骨发育不良和骨代谢异常。

基因信息卡

基因符号 RUNX2
基因全名 RUNX family transcription factor 2
基因类型 protein-coding
染色体位置 6p21.1
NCBI Gene ID 860 ncbi.nlm.nih.gov/gene/860
Ensembl ID ENSG00000124813
UniProt ID Q13950
OMIM ID 600211
HGNC ID 10472
基因别名 AML3, CBFA1, CCD1, OSF2, PEBP2A1, PEBP2A2

基因功能与研究简介

RUNX2(RUNX家族转录因子2)是成骨细胞分化和骨骼发育的关键转录因子,属于RUNX家族。它通过调控多种成骨相关基因的表达,促进间充质干细胞向成骨细胞分化,并参与软骨细胞成熟和骨基质矿化。RUNX2功能异常与颅骨锁骨发育不良(CCD)和骨代谢疾病密切相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
颅骨锁骨发育不良(Cleidocranial Dysplasia, CCD) RUNX2单倍剂量不足或显性负效应导致成骨细胞分化障碍,表现为锁骨发育不全、囟门延迟闭合、牙齿异常等。 已明确致病
骨肉瘤(Osteosarcoma) RUNX2在骨肉瘤中表达异常,可能促进肿瘤细胞增殖和侵袭,但具体机制尚在研究中。 癌症相关
骨质疏松症(Osteoporosis) RUNX2表达水平或活性降低可能影响骨形成,与骨质疏松风险相关,但证据尚不充分。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
骨组织 暂无可靠数据 高表达
成骨细胞 暂无可靠数据 高表达
软骨组织 暂无可靠数据 中等表达
其他组织 暂无可靠数据 低表达或未检测
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
MG-63(骨肉瘤细胞系) 暂无可靠数据 高表达
Saos-2(骨肉瘤细胞系) 暂无可靠数据 高表达
hFOB1.19(成骨细胞系) 暂无可靠数据 高表达
C2C12(成肌细胞系) 暂无可靠数据 低表达,可诱导
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.673C>T (p.Arg225Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致截短蛋白,单倍剂量不足
c.577C>T (p.Arg193Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致截短蛋白,单倍剂量不足
c.391C>T (p.Arg131Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致截短蛋白,单倍剂量不足
c.674G>A (p.Arg225Gln) 错义突变 罕见 可能影响DNA结合,导致功能异常
c.1015C>T (p.Arg339Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致截短蛋白,单倍剂量不足
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

RUNX2功能缺失突变(如无义突变、移码突变)导致单倍剂量不足,是颅骨锁骨发育不良的主要致病机制。

Gain of Function(功能获得,GOF)

RUNX2功能获得性突变在骨肉瘤中可能促进肿瘤进展,但具体证据有限。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

部分错义突变可能产生显性负效应,干扰野生型RUNX2功能,导致更严重的表型。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity) • GO:0005515 (protein binding)
• GO:0005634 (nucleus) • GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II)
• GO:0001503 (ossification) • GO:0030154 (cell differentiation)
• GO:0001649 (osteoblast differentiation)

相关通路

hsa04550 (Signaling pathways regulating pluripotency of stem cells)
hsa04350 (TGF-beta signaling pathway)
hsa04390 (Hippo signaling pathway)
hsa05200 (Pathways in cancer)

蛋白质功能简介

RUNX2蛋白属于RUNX家族,包含Runt结构域,负责DNA结合和与CBFβ形成异二聚体。它作为转录因子,调控成骨细胞特异性基因(如SPP1、BGLAP、COL1A1)的表达,是成骨分化的主控因子。RUNX2还参与细胞周期调控和凋亡,其活性受多种翻译后修饰(如磷酸化、乙酰化)调控。

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