RUNX3基因｜基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RUNX3是TGF-β信号通路的关键转录因子，在肿瘤抑制和免疫调控中发挥重要作用。
基因信息卡
| 基因符号 | RUNX3 |
|---|---|
| 基因全名 | RUNX family transcription factor 3 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1p36.11 |
| NCBI Gene ID | 864 ncbi.nlm.nih.gov/gene/864 |
| Ensembl ID | ENSG00000078328 |
| UniProt ID | Q13761 |
| OMIM ID | 600245 |
| HGNC ID | 10473 |
| 基因别名 | AML2; CBFA3; PEBP2aC |
基因功能与研究简介
RUNX3（RUNX家族转录因子3）是RUNX家族成员之一，编码的蛋白质含有Runt结构域，能够与CBFβ形成异二聚体，结合DNA并调控靶基因表达。RUNX3是TGF-β信号通路的关键下游效应分子，参与细胞增殖、分化、凋亡和免疫调节。RUNX3在多种肿瘤中表达下调或缺失，被认为是一种肿瘤抑制基因。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 胃癌 | RUNX3启动子甲基化导致表达沉默，与胃癌发生发展相关。 | 已明确致病 |
| 乳腺癌 | RUNX3表达下调与乳腺癌进展和不良预后相关。 | 具有较强研究证据 |
| 结直肠癌 | RUNX3失活与结直肠癌的发生相关。 | 具有较强研究证据 |
| 肺癌 | RUNX3表达降低与肺癌的侵袭和转移相关。 | 具有较强研究证据 |
| 肝细胞癌 | RUNX3表达下调与肝癌的进展相关。 | 具有较强研究证据 |
| 胰腺癌 | RUNX3表达缺失与胰腺癌的恶性程度相关。 | 具有较强研究证据 |
| 黑色素瘤 | RUNX3表达下调与黑色素瘤的转移相关。 | 具有较强研究证据 |
| 膀胱癌 | RUNX3表达降低与膀胱癌的预后不良相关。 | 具有较强研究证据 |
| 前列腺癌 | RUNX3表达下调与前列腺癌的进展相关。 | 具有较强研究证据 |
| 卵巢癌 | RUNX3表达缺失与卵巢癌的侵袭性相关。 | 具有较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 胃 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 胰腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 皮肤 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 膀胱 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 前列腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 卵巢 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| MKN28 | 暂无可靠数据 | 胃癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| PANC-1 | 暂无可靠数据 | 胰腺癌细胞系 |
| A375 | 暂无可靠数据 | 黑色素瘤细胞系 |
| T24 | 暂无可靠数据 | 膀胱癌细胞系 |
| PC3 | 暂无可靠数据 | 前列腺癌细胞系 |
| SKOV3 | 暂无可靠数据 | 卵巢癌细胞系 |
数据来源：Human Protein Atlas（proteinatlas.org）
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| 启动子甲基化 | 表观遗传修饰 | 常见 | 导致基因表达沉默，功能丧失 |
| 错义突变 | 点突变 | 罕见 | 可能影响蛋白质功能，但具体影响需进一步研究 |
| 缺失 | 拷贝数变异 | 罕见 | 导致基因缺失，功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function（功能缺失，LOF）
RUNX3功能丧失（Loss of Function）常见于启动子甲基化或基因缺失，导致蛋白质表达缺失或活性降低，从而丧失肿瘤抑制功能。
Gain of Function（功能获得，GOF）
暂无明确证据表明RUNX3存在功能获得性突变（Gain of Function）。
Dominant Negative（显性负效应，DN）
暂无明确证据表明RUNX3存在显性负性突变（Dominant Negative）。
查看完整突变数据：
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003677 DNA binding | • GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity |
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0005737 cytoplasm | • GO:0006355 regulation of transcription |
| • DNA-templated | • GO:0006915 apoptotic process |
| • GO:0007049 cell cycle | • GO:0008283 cell population proliferation |
| • GO:0008285 negative regulation of cell population proliferation | • GO:0010628 positive regulation of gene expression |
| • GO:0030154 cell differentiation | • GO:0030509 BMP signaling pathway |
| • GO:0030513 transforming growth factor beta receptor signaling pathway | • GO:0042127 regulation of cell population proliferation |
| • GO:0045892 negative regulation of transcription | • DNA-templated |
| • GO:0045893 positive regulation of transcription | • DNA-templated |
| • GO:0045944 positive regulation of transcription by RNA polymerase II | • GO:0051092 positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity |
| • GO:2001237 negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway |
相关通路
• TGF-beta signaling pathway (hsa04350)
• Signaling pathways regulating pluripotency of stem cells (hsa04550)
• Pathways in cancer (hsa05200)
• Gastric cancer (hsa05226)
• Breast cancer (hsa05224)
• Colorectal cancer (hsa05210)
• Non-small cell lung cancer (hsa05223)
• Hepatocellular carcinoma (hsa05225)
• Pancreatic cancer (hsa05212)
• Melanoma (hsa05218)
• Bladder cancer (hsa05219)
• Prostate cancer (hsa05215)
• Ovarian cancer (hsa05213)
蛋白质功能简介
RUNX3蛋白属于RUNX家族，包含一个高度保守的Runt结构域，负责与DNA结合和与CBFβ相互作用。RUNX3作为转录因子，在TGF-β信号通路中发挥关键作用，调控靶基因表达，影响细胞增殖、分化和凋亡。RUNX3在多种组织中表达，尤其在胃上皮细胞中高表达，其表达下调或缺失与多种癌症的发生发展密切相关。
联系电话