RXRB基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RXRB是核受体超家族成员,作为类视黄醇X受体的β亚型,在基因调控、代谢和免疫中发挥关键作用。
基因信息卡
| 基因符号 | RXRB |
|---|---|
| 基因全名 | retinoid X receptor beta |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 6p21.32 |
| NCBI Gene ID | 6257 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6257 |
| Ensembl ID | ENSG00000143106 |
| UniProt ID | P28702 |
| OMIM ID | 600460 |
| HGNC ID | 10478 |
| 基因别名 | ['H-2RIIBP', 'NR2B2', 'RXR-beta'] |
基因功能与研究简介
RXRB基因编码类视黄醇X受体β(RXRβ),属于核受体超家族。RXRβ作为配体激活的转录因子,通常与多种核受体形成异二聚体,如维甲酸受体(RAR)、维生素D受体(VDR)和甲状腺激素受体(TR),在调控基因表达中起关键作用。RXRB参与细胞增殖、分化、凋亡和代谢等过程,其功能异常与多种疾病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 代谢综合征 | RXRB基因变异可能影响脂质代谢和胰岛素敏感性,与代谢综合征相关。 | 较强研究证据 |
| 癌症 | RXRB在多种癌症中表达异常,可能通过调控细胞增殖和凋亡影响肿瘤发生发展。 | 潜在关联 |
| 免疫相关疾病 | RXRB参与免疫调节,其变异可能与自身免疫性疾病相关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脂肪组织 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.124A>G (p.Met42Val) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,功能影响未知 |
| c.457C>T (p.Arg153Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响配体结合,功能影响未知 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变,导致蛋白活性降低或丧失,可能影响核受体信号通路。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变,增强蛋白活性或产生新功能,可能促进异常基因表达。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变,突变蛋白干扰野生型蛋白功能,导致信号通路抑制。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003677 DNA binding | • GO:0003707 steroid hormone receptor activity |
| • GO:0004879 nuclear receptor activity | • GO:0005515 protein binding |
| • GO:0005634 nucleus | • GO:0006355 regulation of transcription |
| • DNA-templated | • GO:0045944 positive regulation of transcription by RNA polymerase II |
相关通路
• RXR and RAR heterodimerization
• PPAR signaling pathway
• Vitamin D receptor pathway
蛋白质功能简介
RXRB蛋白(UniProt P28702)是核受体家族成员,包含DNA结合域和配体结合域。它作为转录因子,与RAR、VDR等形成异二聚体,响应配体(如9-顺式维甲酸)调控靶基因表达。RXRB在脂质代谢、细胞分化和免疫应答中发挥重要作用。
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