SACS基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SACS基因编码sacsin蛋白,参与线粒体稳态和蛋白质质量控制,其突变导致常染色体隐性痉挛性共济失调(ARSACS)。
基因信息卡
| 基因符号 | SACS |
|---|---|
| 基因全名 | sacsin molecular chaperone |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 13q12.12 |
| NCBI Gene ID | 26278 ncbi.nlm.nih.gov/gene/26278 |
| Ensembl ID | ENSG00000151835 |
| UniProt ID | Q9NZJ4 |
| OMIM ID | 604490 |
| HGNC ID | 10519 |
| 基因别名 | ['ARSACS', 'DKFZp781H1342', 'FLJ32729', 'KIAA0737', 'SACS1'] |
基因功能与研究简介
SACS基因编码sacsin蛋白,该蛋白包含一个泛素样结构域、一个DnaJ样结构域和一个HepT重复序列,参与线粒体稳态、蛋白质折叠和质量控制。SACS基因突变是常染色体隐性痉挛性共济失调(ARSACS)的主要病因,该病以进行性小脑性共济失调、痉挛和周围神经病变为特征。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 常染色体隐性痉挛性共济失调(ARSACS) | SACS基因纯合或复合杂合突变导致sacsin蛋白功能缺失,影响线粒体功能和蛋白质稳态,导致小脑和脊髓神经元变性。 | 已明确致病 |
| 痉挛性截瘫 | 部分SACS突变可能表现为痉挛性截瘫表型,但证据有限。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 小脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 大脑皮层 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脊髓 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.7395delC (p.Arg2466GlufsTer2) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1163T>C (p.Leu388Pro) | 错义突变 | 罕见 | 可能为Loss of Function |
| c.1321C>T (p.Arg441Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
SACS基因突变导致sacsin蛋白功能缺失或显著降低,是ARSACS的主要致病机制。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明SACS突变具有功能获得效应。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明SACS突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005739 mitochondrion |
| • GO:0006457 protein folding | • GO:0034976 response to endoplasmic reticulum stress |
| • GO:0051082 unfolded protein binding |
相关通路
• Unfolded Protein Response (UPR)
• Mitochondrial dynamics
蛋白质功能简介
sacsin蛋白由SACS基因编码,包含多个结构域,参与线粒体稳态、蛋白质折叠和质量控制。sacsin蛋白功能缺失导致线粒体功能障碍和蛋白质聚集,进而引起神经元变性,尤其在浦肯野细胞中表现明显。