SAMD4B基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SAMD4B是一种RNA结合蛋白,参与mRNA稳定性调控,与肿瘤和神经系统疾病相关。

基因信息卡

基因符号 SAMD4B
基因全名 sterile alpha motif domain containing 4B
基因类型 protein-coding
染色体位置 19q13.2
NCBI Gene ID 55095 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55095
Ensembl ID ENSG00000105607
UniProt ID Q9NX04
OMIM ID 611053
HGNC ID 25492
基因别名 SMAUG2, KIAA1917

基因功能与研究简介

SAMD4B(sterile alpha motif domain containing 4B)编码一种含有无菌α基序(SAM)结构域的RNA结合蛋白,属于Smaug家族。该蛋白在mRNA稳定性调控中发挥重要作用,通过结合mRNA的3'UTR区域促进其降解。SAMD4B在多种组织中表达,尤其在脑和睾丸中高表达。研究表明,SAMD4B参与细胞增殖、分化和凋亡等过程,并与肿瘤发生和神经系统疾病相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肝细胞癌 SAMD4B表达下调与肝细胞癌的进展和不良预后相关,可能通过调控mRNA稳定性影响肿瘤抑制基因的表达。 较强研究证据
结直肠癌 SAMD4B在结直肠癌中表达异常,可能通过影响细胞周期和凋亡参与肿瘤发生。 潜在关联
神经系统疾病 SAMD4B在脑组织中高表达,可能参与神经元发育和突触可塑性,与某些神经系统疾病相关。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 高表达
肝脏 暂无可靠数据 中等表达
肾脏 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Thr412Ala) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
c.567delC (p.Leu189fs) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,可能引起功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如移码突变导致蛋白截短,可能使SAMD4B失去RNA结合能力,影响mRNA降解。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003729 (mRNA binding) • GO:0005515 (protein binding)
• GO:0005737 (cytoplasm) • GO:0006402 (mRNA catabolic process)

相关通路

暂无明确通路

蛋白质功能简介

SAMD4B蛋白含有SAM结构域和RNA结合区域,属于Smaug家族。它通过结合mRNA的3'UTR区域,招募CCR4-NOT复合物,促进mRNA脱腺苷化和降解。SAMD4B在细胞增殖、分化和凋亡中发挥调控作用,其异常表达与肿瘤发生相关。

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