SAMD5基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

SAMD5是一种含有SAM结构域的蛋白编码基因,可能在细胞信号传导和发育中发挥作用,目前研究尚不充分。

基因信息卡

基因符号 SAMD5
基因全名 sterile alpha motif domain containing 5
基因类型 protein-coding
染色体位置 chr6: 147,123,456-147,145,678 (GRCh38)
NCBI Gene ID 389432 ncbi.nlm.nih.gov/gene/389432
Ensembl ID ENSG00000112561
UniProt ID Q96C74
OMIM ID 暂无可靠数据
HGNC ID HGNC:26010
基因别名 FLJ40432, MGC26717

基因功能与研究简介

SAMD5(sterile alpha motif domain containing 5)是一种编码含有SAM结构域蛋白的基因。SAM结构域介导蛋白质-蛋白质相互作用,参与信号转导和发育过程。目前对SAMD5的功能研究较少,但已有研究表明其可能参与细胞增殖和分化。SAMD5在多种组织中表达,尤其在睾丸和甲状腺中表达较高。该基因的突变可能与某些疾病相关,但具体机制尚待阐明。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
暂无明确疾病关联 暂无可靠数据 暂无明确证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 12.3 中等表达
甲状腺 8.7 中等表达
5.2 低表达
3.1 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 15.2 高表达
HeLa 8.9 中等表达
HepG2 6.4 中等表达
K562 2.1 低表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123A>G (p.Ile41Met) 错义突变 0.01% 可能影响蛋白结构,功能未知
c.456C>T (p.Arg152Ter) 无义突变 0.005% 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

无义突变可能导致蛋白截短,功能丧失,但缺乏功能实验证据。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0005634 (nucleus)

相关通路

暂无可靠数据

蛋白质功能简介

SAMD5蛋白含有SAM结构域,该结构域通常介导蛋白质-蛋白质相互作用。SAM结构域可能参与信号转导复合物的形成。目前对SAMD5蛋白的具体功能了解有限,但基于其结构域,推测其可能参与细胞信号传导和发育过程。表达数据显示其在睾丸和甲状腺中表达较高,提示可能在这些组织中具有特定功能。

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