SAMD8基因|基因功能、疾病关联、突变与鞘脂代谢研究

SAMD8编码鞘脂Δ(4)-脱饱和酶,参与神经酰胺代谢,其突变与遗传性痉挛性截瘫相关。

基因信息卡

基因符号 SAMD8
基因全名 sterile alpha motif domain containing 8
基因类型 protein-coding
染色体位置 10q22.2
NCBI Gene ID 142891 ncbi.nlm.nih.gov/gene/142891
Ensembl ID ENSG00000119965
UniProt ID Q96LT4
OMIM ID 610567
HGNC ID 25491
基因别名 SAMD8, FLJ22175, MGC138234

基因功能与研究简介

SAMD8(sterile alpha motif domain containing 8)编码鞘脂Δ(4)-脱饱和酶,催化二氢神经酰胺转化为神经酰胺,是鞘脂代谢的关键酶。该基因突变可导致遗传性痉挛性截瘫(SPG79),影响神经系统功能。SAMD8在多种组织中表达,尤其在脑和睾丸中高表达。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
遗传性痉挛性截瘫79型(SPG79) SAMD8基因纯合或复合杂合突变导致酶活性丧失,影响鞘脂代谢,导致轴突变性和痉挛性截瘫。 已明确致病
癌症 SAMD8在多种癌症中表达异常,可能通过调节鞘脂代谢影响肿瘤进展,但具体机制尚不明确。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.112C>T (p.Arg38Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.638G>A (p.Arg213His) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.1000C>T (p.Arg334Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

SAMD8功能缺失突变(如无义突变)导致酶活性丧失,影响神经酰胺合成,是SPG79的主要致病机制。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明SAMD8存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明SAMD8突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0016215 (sphingolipid delta-4 desaturase activity) • GO:0005783 (endoplasmic reticulum)
• GO:0006672 (ceramide biosynthetic process) • GO:0005515 (protein binding)

相关通路

Sphingolipid metabolism (KEGG: map00600)
Sphingolipid signaling pathway (KEGG: map04071)

蛋白质功能简介

SAMD8蛋白定位于内质网,属于脂肪酸脱饱和酶家族,含有SAM结构域。该蛋白催化二氢神经酰胺C4位脱氢生成神经酰胺,是鞘脂从头合成途径的关键步骤。SAMD8功能异常可导致神经酰胺水平改变,影响细胞信号传导和细胞凋亡。

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