SAMD9基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SAMD9是一种参与细胞增殖调控和抗病毒免疫的关键基因,其突变与MIRAGE综合征及肿瘤发生密切相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SAMD9 |
|---|---|
| 基因全名 | sterile alpha motif domain containing 9 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 7q21.2 |
| NCBI Gene ID | 54809 ncbi.nlm.nih.gov/gene/54809 |
| Ensembl ID | ENSG00000164619 |
| UniProt ID | Q5HYW2 |
| OMIM ID | 610456 |
| HGNC ID | 1348 |
| 基因别名 | C7orf5, DRIF1, OEF1, SAMD9 |
基因功能与研究简介
SAMD9(sterile alpha motif domain containing 9)基因编码一种含有无菌α基序(SAM)结构域的蛋白质,该蛋白在细胞增殖、凋亡、抗病毒免疫和炎症反应中发挥重要调控作用。SAMD9通过其SAM结构域参与蛋白质-蛋白质相互作用,并可能作为肿瘤抑制因子,其功能异常与多种疾病相关,尤其是MIRAGE综合征(骨髓增生异常、感染、生长受限、肾上腺发育不全、生殖器异常和肠病)以及某些肿瘤的发生发展。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| MIRAGE综合征 | SAMD9基因功能获得性突变导致细胞增殖抑制和凋亡增加,引起多系统发育异常,包括骨髓增生异常、免疫缺陷、生长受限、肾上腺发育不全、生殖器异常和肠病。 | 已明确致病 |
| 骨髓增生异常综合征(MDS) | SAMD9突变(尤其是功能获得性突变)与MDS相关,可能通过影响造血干细胞的增殖和分化导致疾病。 | 较强研究证据 |
| 急性髓系白血病(AML) | SAMD9突变在AML中亦有报道,可能参与白血病发生,但具体机制尚需进一步研究。 | 潜在关联 |
| 感染易感性 | SAMD9参与抗病毒免疫,其功能异常可能增加对病毒感染的易感性,但具体证据有限。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 高表达(根据GTEx和HPA数据,SAMD9在骨髓中表达较高) |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 淋巴结 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 胸腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| K562 | 暂无可靠数据 | 白血病细胞系,SAMD9表达较高 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系,SAMD9表达中等 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系,SAMD9表达较低 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系,SAMD9表达中等 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.2950C>T (p.Arg984Trp) | 错义突变 | 罕见 | 功能获得性突变,导致细胞增殖抑制增强,与MIRAGE综合征相关 |
| c.2951G>A (p.Arg984Gln) | 错义突变 | 罕见 | 功能获得性突变,与MIRAGE综合征相关 |
| c.2971C>T (p.Arg991Trp) | 错义突变 | 罕见 | 功能获得性突变,与MIRAGE综合征相关 |
| c.2972G>A (p.Arg991Gln) | 错义突变 | 罕见 | 功能获得性突变,与MIRAGE综合征相关 |
| c.2980C>T (p.Arg994Trp) | 错义突变 | 罕见 | 功能获得性突变,与MIRAGE综合征相关 |
| c.2981G>A (p.Arg994Gln) | 错义突变 | 罕见 | 功能获得性突变,与MIRAGE综合征相关 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
SAMD9功能缺失突变可能导致细胞增殖失控,与肿瘤发生相关,但具体证据有限。
Gain of Function(功能获得,GOF)
SAMD9功能获得性突变增强其抑制细胞增殖和促进凋亡的作用,是MIRAGE综合征的主要致病机制。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明SAMD9存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0005829 (cytosol) | • GO:0005634 (nucleus) |
| • GO:0008283 (cell population proliferation) | • GO:0006915 (apoptotic process) |
| • GO:0009615 (response to virus) | • GO:0045087 (innate immune response) |
相关通路
• hsa04620 (Toll-like receptor signaling pathway)
• hsa04621 (NOD-like receptor signaling pathway)
• hsa05164 (Influenza A)
• hsa05168 (Herpes simplex virus 1 infection)
蛋白质功能简介
SAMD9蛋白包含一个SAM结构域,该结构域介导蛋白质-蛋白质相互作用。SAMD9在细胞增殖调控中发挥重要作用,通过抑制细胞周期进程和促进凋亡来抑制肿瘤生长。此外,SAMD9参与抗病毒免疫应答,可能通过调节干扰素信号通路来抵抗病毒感染。SAMD9的突变(尤其是功能获得性突变)可导致MIRAGE综合征,表现为多系统发育异常。
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