SARDH基因|功能、疾病关联、突变与代谢研究
SARDH基因编码肌氨酸脱氢酶,参与胆碱代谢,其突变与肌氨酸血症相关,并在多种癌症中表达异常。
基因信息卡
| 基因符号 | SARDH |
|---|---|
| 基因全名 | sarcosine dehydrogenase |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 9q34.11 |
| NCBI Gene ID | 6457 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6457 |
| Ensembl ID | ENSG00000123457 |
| UniProt ID | Q9UL12 |
| OMIM ID | 604455 |
| HGNC ID | 10538 |
| 基因别名 | SARDH, FLJ21019, MGC126562, MGC126564, SARD |
基因功能与研究简介
SARDH基因编码肌氨酸脱氢酶,该酶位于线粒体基质,催化肌氨酸(N-甲基甘氨酸)氧化脱甲基生成甘氨酸和5,10-亚甲基四氢叶酸。此反应是胆碱代谢和叶酸循环的关键步骤。SARDH在肝脏、肾脏和胰腺中高表达,参与能量代谢和氨基酸代谢。SARDH基因突变可导致肌氨酸血症(sarcosinemia),一种常染色体隐性遗传病,表现为血浆和尿液中肌氨酸水平升高。此外,SARDH在多种癌症中表达异常,可能作为肿瘤抑制因子或代谢调节因子。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肌氨酸血症 | SARDH基因纯合或复合杂合突变导致酶活性丧失,肌氨酸无法正常代谢,在体液中蓄积。 | 已明确致病 |
| 肝细胞癌 | SARDH表达下调与肝细胞癌的进展和不良预后相关,可能通过影响代谢重编程。 | 具有较强研究证据 |
| 结直肠癌 | SARDH表达异常与结直肠癌的发生发展相关,可能参与肿瘤代谢。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 胰腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.532C>T (p.Arg178Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1003G>A (p.Gly335Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白折叠或催化活性 |
| c.1211A>G (p.Tyr404Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响酶活性 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
导致酶活性丧失或降低,如无义突变、移码突变等。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0009115 | • GO:0005739 |
| • GO:0006545 | • GO:0009055 |
| • GO:0016491 | • GO:0005506 |
相关通路
• Glycine
• serine and threonine metabolism (hsa00260)
• Metabolic pathways (hsa01100)
蛋白质功能简介
SARDH蛋白由约1000个氨基酸组成,定位于线粒体基质。该蛋白属于黄素蛋白家族,含有FAD结合域和铁硫簇,催化肌氨酸的氧化脱甲基反应。SARDH在肝脏、肾脏和胰腺中高表达,参与胆碱代谢和叶酸循环。其活性受底物和产物调控,并可能受翻译后修饰影响。