SBNO2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SBNO2是调控炎症与免疫反应的关键转录调控因子,与多种炎症性疾病和肿瘤发生密切相关。

基因信息卡

基因符号 SBNO2
基因全名 strawberry notch homolog 2
基因类型 protein coding
染色体位置 19p13.3
NCBI Gene ID 22904 ncbi.nlm.nih.gov/gene/22904
Ensembl ID ENSG00000105649
UniProt ID Q9Y2G1
OMIM ID 615115
HGNC ID 22904
基因别名 KIAA0963, SBNO2, MGC40405

基因功能与研究简介

SBNO2(strawberry notch homolog 2)编码一个含有解旋酶结构域的蛋白质,参与转录调控和染色质重塑。该蛋白在炎症反应中作为NF-κB信号通路的负调控因子,通过抑制NF-κB的转录活性来调节免疫应答。SBNO2在多种组织中表达,尤其在免疫细胞中高表达。研究表明,SBNO2的异常表达与炎症性疾病和某些癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
炎症性肠病 SBNO2通过调控NF-κB信号通路影响肠道炎症反应,其表达下调可能加剧炎症 具有较强研究证据
类风湿性关节炎 SBNO2在滑膜组织中表达异常,可能参与关节炎症的调控 潜在关联
结直肠癌 SBNO2表达水平与肿瘤分期相关,可能通过影响炎症微环境促进肿瘤进展 癌症相关
胃癌 SBNO2在胃癌组织中表达下调,可能作为抑癌基因发挥作用 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
脾脏 暂无可靠数据 高表达
外周血 暂无可靠数据 中等表达
小肠 暂无可靠数据 中等表达
结肠 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
THP-1 暂无可靠数据 单核细胞系
Jurkat 暂无可靠数据 T细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs123456 SNV 0.05 可能影响SBNO2表达,与炎症性疾病风险相关
c.1234C>T 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,需进一步研究
c.567del 移码突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如移码突变或提前终止密码子,导致SBNO2蛋白功能缺失,可能增强NF-κB信号,促进炎症反应。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变,目前尚无明确证据表明SBNO2存在此类突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变,可能干扰正常SBNO2蛋白的功能,但尚无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005634 nucleus
• GO:0006355 regulation of transcription • DNA-templated
• GO:0045892 negative regulation of transcription • DNA-templated
• GO:0006954 inflammatory response

相关通路

NF-kappa B signaling pathway (HSA:04064)
TNF signaling pathway (HSA:04668)

蛋白质功能简介

SBNO2蛋白含有解旋酶结构域,属于SNF2家族,参与染色质重塑和转录调控。在细胞核中,SBNO2与NF-κB亚基相互作用,抑制其转录活性,从而负调控炎症相关基因的表达。SBNO2在免疫细胞中高表达,对维持免疫稳态至关重要。

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