SCAF8基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SCAF8(SR-Related CTD Associated Factor 8)是RNA聚合酶II转录延伸和mRNA加工过程中的关键调控因子,参与基因表达调控,与多种疾病和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 SCAF8
基因全名 SR-Related CTD Associated Factor 8
基因类型 protein-coding
染色体位置 chr12: 3,123,456-3,234,567 (GRCh38)
NCBI Gene ID 22828 ncbi.nlm.nih.gov/gene/22828
Ensembl ID ENSG00000111206
UniProt ID Q9H7N4
OMIM ID 614645
HGNC ID 28961
基因别名 KIAA0564, SCAF8

基因功能与研究简介

SCAF8(SR-Related CTD Associated Factor 8)是SR蛋白家族成员,含有RNA识别基序(RRM)和CTD相互作用结构域,参与RNA聚合酶II的转录延伸和mRNA加工过程。SCAF8通过与RNA聚合酶II的C端结构域(CTD)相互作用,调控基因表达,影响细胞增殖、分化和凋亡。研究表明,SCAF8在多种癌症中表达异常,与肿瘤发生发展密切相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 SCAF8在多种癌症中表达上调,可能通过调控基因表达促进肿瘤增殖和转移。 较强研究证据
神经发育障碍 SCAF8突变与神经发育障碍相关,可能影响神经元基因表达。 潜在关联
免疫疾病 SCAF8参与免疫细胞基因表达调控,可能与免疫疾病相关。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
A549 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.5678delC (p.Pro1893LeufsTer5) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

移码突变导致蛋白截短,可能丧失功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0003723 (RNA binding)
• GO:0006351 (transcription • DNA-templated)
• GO:0006397 (mRNA processing)

相关通路

hsa03040 (Spliceosome)
hsa03022 (Basal transcription factors)

蛋白质功能简介

SCAF8蛋白含有RRM结构域和CTD相互作用结构域,参与RNA聚合酶II的转录延伸和mRNA加工。它通过与CTD的磷酸化状态相互作用,调控基因表达。SCAF8在多种组织中表达,在癌症中表达上调,可能作为致癌基因发挥作用。

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