SCAPER基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SCAPER基因编码细胞周期调控相关蛋白,参与纤毛形成和细胞周期进程,其突变与视网膜色素变性和智力障碍相关。

基因信息卡

基因符号 SCAPER
基因全名 S-phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum
基因类型 protein-coding
染色体位置 15q24.3
NCBI Gene ID 49855 ncbi.nlm.nih.gov/gene/49855
Ensembl ID ENSG00000140398
UniProt ID Q8WY24
OMIM ID 611611
HGNC ID 24405
基因别名 FLJ12975, MGC29643, Zfp292

基因功能与研究简介

SCAPER基因编码一种定位于内质网的蛋白质,参与细胞周期调控和纤毛形成。研究表明,SCAPER与细胞周期蛋白A相互作用,可能在S期进程中发挥作用。此外,SCAPER突变与常染色体隐性视网膜色素变性和非综合征型智力障碍相关。该基因在多种组织中表达,尤其在睾丸和脑中表达较高。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
视网膜色素变性 SCAPER基因突变导致纤毛功能异常,影响视网膜感光细胞存活,引起进行性视力丧失。 已明确致病
非综合征型智力障碍 SCAPER突变影响神经元发育和功能,导致认知障碍。 具有较强研究证据
癌症相关 SCAPER在多种肿瘤中表达异常,可能参与肿瘤发生,但具体机制尚不明确。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
视网膜 暂无可靠数据 表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234C>T (p.Arg412Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.2345delA (p.Lys782fs) 移码突变 罕见 Loss of Function
c.3456G>A (p.Trp1152Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变,导致SCAPER蛋白截短或降解,影响其正常功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0005783 (endoplasmic reticulum) • GO:0005813 (centrosome)
• GO:0007049 (cell cycle) • GO:0060271 (cilium assembly)

相关通路

Cilium Assembly (GO:0060271)
Cell Cycle (KEGG:04110)

蛋白质功能简介

SCAPER蛋白由1248个氨基酸组成,含有锌指结构域,定位于内质网和中心体。它参与细胞周期调控,与细胞周期蛋白A相互作用,可能在S期进程中起作用。此外,SCAPER参与纤毛形成,其功能缺失可导致纤毛缺陷,进而引发视网膜色素变性和智力障碍。

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