SCARA3基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究
SCARA3(巨噬细胞清道夫受体3)在氧化应激反应和细胞保护中发挥重要作用,与多种疾病和癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SCARA3 |
|---|---|
| 基因全名 | scavenger receptor class A member 3 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 8p21.1 |
| NCBI Gene ID | 51435 ncbi.nlm.nih.gov/gene/51435 |
| Ensembl ID | ENSG00000104447 |
| UniProt ID | Q6AZY7 |
| OMIM ID | 602804 |
| HGNC ID | 10669 |
| 基因别名 | MSLR1, APC7, CSR1, SCARA3 |
基因功能与研究简介
SCARA3(清道夫受体A类成员3)是一种跨膜蛋白,属于清道夫受体家族。该蛋白在氧化应激反应中表达上调,参与清除氧化修饰的低密度脂蛋白(oxLDL)和活性氧(ROS),从而发挥细胞保护作用。SCARA3在多种组织中表达,尤其在肺、脾和胎盘中水平较高。研究表明,SCARA3可能通过调节氧化应激和炎症反应参与动脉粥样硬化、肺纤维化等疾病的发生发展,并在多种癌症中表现出异常表达,提示其可能作为肿瘤抑制因子或癌基因。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 动脉粥样硬化 | SCARA3在动脉粥样硬化斑块中表达上调,可能通过清除oxLDL和抗氧化应激发挥保护作用,但具体机制尚不完全明确。 | 具有较强研究证据 |
| 肺纤维化 | SCARA3在肺纤维化组织中表达增加,可能参与纤维化过程中的氧化应激反应和胶原沉积调节。 | 具有较强研究证据 |
| 乳腺癌 | SCARA3在乳腺癌中表达下调,可能作为肿瘤抑制因子,其低表达与不良预后相关。 | 具有较强研究证据 |
| 前列腺癌 | SCARA3在前列腺癌中表达异常,可能通过影响氧化应激和细胞凋亡参与肿瘤进展。 | 潜在关联 |
| 结直肠癌 | SCARA3在结直肠癌中表达下调,可能通过调节氧化应激和免疫应答影响肿瘤发生。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肺 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 脾 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 胎盘 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| PC3 | 暂无可靠数据 | 前列腺癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,功能影响未知 |
| c.567delA (p.Lys189fs) | 移码突变 | 罕见 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.890G>A (p.Arg297His) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响配体结合,功能影响未知 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,如移码突变导致蛋白截短,可能使SCARA3失去清除氧化脂质和抗氧化应激的能力,从而增加疾病风险。
Gain of Function(功能获得,GOF)
目前暂无明确证据表明SCARA3存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
目前暂无明确证据表明SCARA3存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005044 (scavenger receptor activity) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
| • GO:0006979 (response to oxidative stress) | • GO:0006915 (apoptotic process) |
| • GO:0008285 (negative regulation of cell proliferation) |
相关通路
• hsa04115 (p53 signaling pathway)
• hsa04210 (Apoptosis)
• hsa04620 (Toll-like receptor signaling pathway)
蛋白质功能简介
SCARA3蛋白是一种I型跨膜糖蛋白,属于清道夫受体A类家族。该蛋白包含一个N端胞外结构域,具有胶原蛋白样结构,能够结合多种配体,包括氧化修饰的低密度脂蛋白(oxLDL)、细菌和凋亡细胞。SCARA3在细胞表面以三聚体形式存在,通过内吞作用清除有害配体,从而保护细胞免受氧化应激和炎症损伤。此外,SCARA3还参与细胞凋亡的调控,可能通过调节p53信号通路影响细胞命运。