SCARA5基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

SCARA5是一种清道夫受体,参与铁代谢和先天免疫,与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 SCARA5
基因全名 scavenger receptor class A member 5
基因类型 protein-coding
染色体位置 8p21.1
NCBI Gene ID 286133 ncbi.nlm.nih.gov/gene/286133
Ensembl ID ENSG00000168079
UniProt ID Q6AZ09
OMIM ID 614925
HGNC ID 24279
基因别名 TESR, Scara5

基因功能与研究简介

SCARA5(清道夫受体A类成员5)是一种跨膜蛋白,属于清道夫受体家族。它主要在胎盘中高表达,也存在于其他组织。SCARA5参与铁代谢,通过结合铁蛋白介导细胞对铁的吸收,同时具有细菌清除和免疫调节功能。研究表明SCARA5在多种癌症中表达下调,可能作为肿瘤抑制因子。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肝细胞癌 SCARA5表达下调与肝细胞癌进展相关,可能通过影响铁代谢和细胞增殖。 较强研究证据
乳腺癌 SCARA5在乳腺癌中表达降低,与不良预后相关。 较强研究证据
肾细胞癌 SCARA5表达减少与肾癌发生发展有关。 潜在关联
铁代谢紊乱 SCARA5参与铁蛋白摄取,其功能异常可能导致铁代谢失衡。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
胎盘 暂无可靠数据 高表达
肝脏 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
肾脏 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234C>T (p.Arg412Ter) 无义突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
c.567G>A (p.Trp189Ter) 无义突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
c.890A>G (p.Gln297Arg) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,功能未知
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

无义突变或移码突变导致蛋白截短或降解,功能丧失。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005044 (scavenger receptor activity) • GO:0005886 (plasma membrane)
• GO:0006810 (transport) • GO:0006955 (immune response)
• GO:0006879 (cellular iron ion homeostasis)

相关通路

铁代谢相关通路
清道夫受体介导的内吞作用

蛋白质功能简介

SCARA5蛋白是一种II型跨膜糖蛋白,包含一个细胞外结构域,具有清道夫受体活性。它能够结合多种配体,包括铁蛋白、细菌和氧化低密度脂蛋白。SCARA5通过内吞作用介导细胞对铁蛋白的摄取,从而调节细胞内铁水平。此外,它还参与细菌清除和炎症反应。

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