SCARA5基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究
SCARA5是一种清道夫受体,参与铁代谢和先天免疫,与多种疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SCARA5 |
|---|---|
| 基因全名 | scavenger receptor class A member 5 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 8p21.1 |
| NCBI Gene ID | 286133 ncbi.nlm.nih.gov/gene/286133 |
| Ensembl ID | ENSG00000168079 |
| UniProt ID | Q6AZ09 |
| OMIM ID | 614925 |
| HGNC ID | 24279 |
| 基因别名 | TESR, Scara5 |
基因功能与研究简介
SCARA5(清道夫受体A类成员5)是一种跨膜蛋白,属于清道夫受体家族。它主要在胎盘中高表达,也存在于其他组织。SCARA5参与铁代谢,通过结合铁蛋白介导细胞对铁的吸收,同时具有细菌清除和免疫调节功能。研究表明SCARA5在多种癌症中表达下调,可能作为肿瘤抑制因子。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肝细胞癌 | SCARA5表达下调与肝细胞癌进展相关,可能通过影响铁代谢和细胞增殖。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | SCARA5在乳腺癌中表达降低,与不良预后相关。 | 较强研究证据 |
| 肾细胞癌 | SCARA5表达减少与肾癌发生发展有关。 | 潜在关联 |
| 铁代谢紊乱 | SCARA5参与铁蛋白摄取,其功能异常可能导致铁代谢失衡。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 胎盘 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Ter) | 无义突变 | 罕见 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.567G>A (p.Trp189Ter) | 无义突变 | 罕见 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.890A>G (p.Gln297Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,功能未知 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变或移码突变导致蛋白截短或降解,功能丧失。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005044 (scavenger receptor activity) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
| • GO:0006810 (transport) | • GO:0006955 (immune response) |
| • GO:0006879 (cellular iron ion homeostasis) |
相关通路
• 铁代谢相关通路
• 清道夫受体介导的内吞作用
蛋白质功能简介
SCARA5蛋白是一种II型跨膜糖蛋白,包含一个细胞外结构域,具有清道夫受体活性。它能够结合多种配体,包括铁蛋白、细菌和氧化低密度脂蛋白。SCARA5通过内吞作用介导细胞对铁蛋白的摄取,从而调节细胞内铁水平。此外,它还参与细菌清除和炎症反应。