SCHIP1基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究
SCHIP1(Schwannomin Interacting Protein 1)是一种与神经发育和细胞骨架调控相关的蛋白,其突变可能与神经发育障碍和肿瘤发生有关。
基因信息卡
| 基因符号 | SCHIP1 |
|---|---|
| 基因全名 | Schwannomin Interacting Protein 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 3q25.33 |
| NCBI Gene ID | 29970 ncbi.nlm.nih.gov/gene/29970 |
| Ensembl ID | ENSG00000114544 |
| UniProt ID | Q9BWM7 |
| OMIM ID | 609683 |
| HGNC ID | 20187 |
| 基因别名 | SCHIP-1, KIAA1970 |
基因功能与研究简介
SCHIP1(Schwannomin Interacting Protein 1)基因编码一种与神经纤维瘤病2型(NF2)蛋白(merlin/schwannomin)相互作用的蛋白。该蛋白参与细胞骨架调控、细胞迁移和神经发育过程。SCHIP1在脑组织中高表达,可能参与神经元分化和突触形成。研究表明,SCHIP1的异常表达或突变与某些神经发育障碍和肿瘤(如胶质瘤)相关,但具体机制仍在研究中。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 神经发育障碍 | SCHIP1突变可能影响神经元迁移和分化,导致智力障碍或自闭症谱系障碍,但证据尚不充分。 | 暂无明确证据 |
| 胶质瘤 | SCHIP1在胶质瘤中表达异常,可能通过调控细胞骨架影响肿瘤侵袭,但机制未明。 | 潜在关联 |
| 精神分裂症 | 部分研究提示SCHIP1基因多态性与精神分裂症风险相关,但需进一步验证。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
| U87 | 暂无可靠数据 | 胶质母细胞瘤细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Thr412Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,功能影响未知 |
| c.567delC (p.Leu190TrpfsTer23) | 移码突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,可能丧失功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
移码突变导致截短蛋白,可能丧失与merlin相互作用的功能,影响细胞骨架调控。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0005856 (cytoskeleton) | • GO:0007399 (nervous system development) |
相关通路
• Pathway: hsa04520 (Adherens junction)
• Pathway: hsa04810 (Regulation of actin cytoskeleton)
蛋白质功能简介
SCHIP1蛋白含有卷曲螺旋结构域,可与merlin蛋白相互作用,参与细胞骨架重组和细胞迁移。在神经系统中,SCHIP1可能调节神经元形态发生和突触可塑性。其表达异常与肿瘤侵袭性相关,但具体分子机制尚待阐明。
相关产品
| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID | |
|---|---|---|---|---|
| SCHIP1基因敲除HCT116细胞 | EDJ-KQ73073 | 人 | 29970 | 详情 立即询价 |
| IQCJ-SCHIP1基因敲除HCT116细胞 | EDJ-KQ77728 | 人 | 100505385 | 详情 立即询价 |
| SCHIP1基因敲除A549细胞 | EDJ-KQ64621 | 人 | 29970 | 详情 立即询价 |
| IQCJ-SCHIP1基因敲除A549细胞 | EDJ-KQ69375 | 人 | 100505385 | 详情 立即询价 |
| SCHIP1基因敲除HEK293细胞 | EDJ-KQ51248 | 人 | 29970 | 详情 立即询价 |
| IQCJ-SCHIP1基因敲除HEK293细胞 | EDJ-KQ52459 | 人 | 100505385 | 详情 立即询价 |
| SCHIP1基因敲除Hela细胞 | EDJ-KQ56134 | 人 | 29970 | 详情 立即询价 |
| IQCJ-SCHIP1基因敲除Hela细胞 | EDJ-KQ60900 | 人 | 100505385 | 详情 立即询价 |
Displaying Records 1 To 8 Of 8 Records