SCLY基因|硒代半胱氨酸裂解酶功能、疾病关联、突变与代谢研究
SCLY基因编码硒代半胱氨酸裂解酶,参与硒蛋白代谢和氧化还原平衡,其变异与硒代谢异常及多种疾病风险相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SCLY |
|---|---|
| 基因全名 | selenocysteine lyase |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 2q37.3 |
| NCBI Gene ID | 51540 ncbi.nlm.nih.gov/gene/51540 |
| Ensembl ID | ENSG00000115594 |
| UniProt ID | Q96I15 |
| OMIM ID | 610072 |
| HGNC ID | HGNC:20685 |
| 基因别名 | hSCL, SCL, SCLY1 |
基因功能与研究简介
SCLY基因编码硒代半胱氨酸裂解酶,该酶催化硒代半胱氨酸分解为丙氨酸和硒化氢,是硒代谢的关键酶。SCLY通过调控硒的利用,影响硒蛋白的合成,进而参与氧化还原平衡、炎症反应和细胞增殖等过程。SCLY在多种组织中表达,尤其在肝脏、肾脏和睾丸中高表达。研究表明,SCLY的变异与硒代谢异常、心血管疾病、神经退行性疾病及某些癌症的风险相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 硒缺乏相关疾病 | SCLY功能缺失导致硒利用障碍,影响硒蛋白合成,可能增加氧化应激相关疾病风险。 | ClinVar, OMIM |
| 心血管疾病 | SCLY变异可能影响硒蛋白表达,与动脉粥样硬化等心血管疾病风险相关。 | ClinVar, PubMed |
| 癌症 | SCLY表达异常与多种癌症(如结直肠癌、前列腺癌)的发生发展相关,可能通过调节硒代谢影响肿瘤生长。 | COSMIC, PubMed |
| 神经退行性疾病 | SCLY变异可能影响硒蛋白在神经系统的保护作用,与阿尔茨海默病等疾病风险相关。 | PubMed |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.457C>T (p.Arg153Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1043G>A (p.Arg348His) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响酶活性 |
| c.1186C>T (p.Arg396Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变或移码突变导致蛋白截短或降解,使酶活性丧失,影响硒代谢。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0009000 - selenocysteine lyase activity | • GO:0005737 - cytoplasm |
| • GO:0005829 - cytosol | • GO:0005739 - mitochondrion |
| • GO:0006979 - response to oxidative stress | • GO:0008652 - cellular amino acid biosynthetic process |
相关通路
• Selenium metabolism (Reactome: R-HSA-2408508)
• Selenoamino acid metabolism (KEGG: hsa00450)
蛋白质功能简介
SCLY蛋白由432个氨基酸组成,属于II类吡哆醛磷酸依赖性酶家族。该蛋白以同源二聚体形式存在,定位于细胞质和线粒体。SCLY催化硒代半胱氨酸的C-Se键断裂,释放硒化氢和丙氨酸。硒化氢是硒蛋白合成的关键底物,因此SCLY在硒的再利用和硒蛋白合成中起核心作用。SCLY的活性受硒水平调控,在硒缺乏时表达上调以维持硒稳态。