SCML2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SCML2是Polycomb家族成员,参与基因转录调控和生殖细胞发育,与男性不育和肿瘤发生相关。

基因信息卡

基因符号 SCML2
基因全名 Sex comb on midleg-like 2 (Drosophila)
基因类型 protein-coding
染色体位置 Xp22.13
NCBI Gene ID 10389 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10389
Ensembl ID ENSG00000169855
UniProt ID Q9UQR0
OMIM ID 300197
HGNC ID 10587
基因别名 SCML2A, SCML2B, FLJ20032

基因功能与研究简介

SCML2(Sex comb on midleg-like 2)是Polycomb家族的一员,编码一种含有MBT重复结构域的蛋白质。该蛋白参与基因转录的调控,特别是在生殖细胞发育过程中,通过介导组蛋白修饰和染色质重塑来调节基因表达。SCML2在睾丸中高表达,对精子发生至关重要。此外,SCML2的异常表达与多种肿瘤相关,可能参与肿瘤的发生和发展。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
男性不育 SCML2突变导致精子发生障碍,影响男性生育能力。 ClinVar
肿瘤 SCML2在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控基因表达促进肿瘤发生。 COSMIC

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 高表达
其他组织 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
NT2/D1 暂无可靠数据 睾丸畸胎瘤细胞系
其他细胞系 暂无可靠数据 暂无明确证据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234C>T (p.Arg412Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.567del (p.Gly190ValfsTer23) 移码突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变,导致SCML2蛋白功能丧失,影响精子发生。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0006325 (chromatin organization) • GO:0006355 (regulation of transcription
• DNA-templated) • GO:0007283 (spermatogenesis)

相关通路

hsa04136 (Autophagy - other)
hsa04914 (Progesterone-mediated oocyte maturation)

蛋白质功能简介

SCML2蛋白属于Polycomb家族,含有MBT重复结构域,能够识别甲基化的组蛋白赖氨酸残基,参与基因转录的抑制。在睾丸中,SCML2对于精子发生过程中的基因表达调控至关重要,其缺失会导致精子发生阻滞。此外,SCML2在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控细胞增殖和凋亡相关基因的表达来影响肿瘤进展。

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