SCRT1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SCRT1(Snail家族转录抑制因子1)在神经发育和癌症中发挥关键作用,是研究转录调控和疾病机制的重要靶点。

基因信息卡

基因符号 SCRT1
基因全名 snail family transcriptional repressor 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 3q24
NCBI Gene ID 4193 ncbi.nlm.nih.gov/gene/4193
Ensembl ID ENSG00000163823
UniProt ID Q9BWW7
OMIM ID 607779
HGNC ID 10497
基因别名 ZNF898, SCRT, Snail-related zinc finger protein

基因功能与研究简介

SCRT1基因编码Snail家族转录抑制因子1,属于锌指转录因子家族。该蛋白在神经发育中发挥关键作用,参与调控神经嵴细胞的迁移和分化。此外,SCRT1在多种癌症中异常表达,可能通过调控上皮-间质转化(EMT)影响肿瘤侵袭和转移。SCRT1的突变和表达异常与多种疾病相关,是癌症研究和神经发育研究的重要靶点。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经嵴相关疾病 SCRT1在神经嵴细胞发育中起关键作用,其功能异常可能导致神经嵴相关疾病,如先天性巨结肠等。 暂无明确证据
癌症 SCRT1在多种癌症中表达异常,可能通过调控EMT促进肿瘤侵袭和转移。 具有较强研究证据
其他潜在关联 SCRT1可能与其他神经系统疾病相关,但具体机制尚不明确。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
脊髓 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
其他组织 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
其他细胞系 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123C>T (p.Arg41Ter) 无义突变 罕见 可能导致Loss of Function
c.456G>A (p.Trp152Ter) 无义突变 罕见 可能导致Loss of Function
c.789delC (p.Pro264LeufsTer5) 移码突变 罕见 可能导致Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变,导致SCRT1蛋白功能丧失或减弱,可能影响神经发育或促进肿瘤发生。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003677 DNA binding • GO:0000978 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
• GO:0001227 DNA-binding transcription repressor activity • RNA polymerase II-specific
• GO:0005634 nucleus • GO:0006355 regulation of transcription
• DNA-templated • GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II
• GO:0007275 multicellular organism development • GO:0007399 nervous system development
• GO:0010628 positive regulation of gene expression • GO:0010629 negative regulation of gene expression

相关通路

Epithelial to mesenchymal transition (EMT) pathway
Neural crest differentiation pathway

蛋白质功能简介

SCRT1蛋白属于Snail家族转录抑制因子,包含锌指结构域,能够结合DNA并抑制靶基因转录。在神经发育中,SCRT1调控神经嵴细胞的迁移和分化;在癌症中,SCRT1可能通过调控EMT促进肿瘤侵袭和转移。其表达和功能异常与多种疾病相关,是潜在的治疗靶点。

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