SCRT2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SCRT2(Snail家族转录抑制因子2)在神经发育和癌症中发挥重要作用,其突变与神经发育障碍和肿瘤发生相关。

基因信息卡

基因符号 SCRT2
基因全名 snail family transcriptional repressor 2
基因类型 protein-coding
染色体位置 20p13
NCBI Gene ID 84708 ncbi.nlm.nih.gov/gene/84708
Ensembl ID ENSG00000101210
UniProt ID Q9NQ03
OMIM ID 607779
HGNC ID 15951
基因别名 ZNF898B, SCRT2, FLJ23356

基因功能与研究简介

SCRT2(Snail家族转录抑制因子2)属于Snail家族转录因子,包含锌指结构域,主要作为转录抑制因子参与调控基因表达。SCRT2在神经发育中发挥重要作用,可能参与神经嵴细胞的分化和迁移。此外,SCRT2在多种癌症中表达异常,与肿瘤的发生发展相关。研究表明,SCRT2可能通过调控上皮-间质转化(EMT)影响肿瘤侵袭和转移。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 SCRT2突变可能导致神经发育异常,但具体机制尚不明确。 暂无明确证据
癌症 SCRT2在多种癌症中表达异常,可能通过调控EMT促进肿瘤侵袭和转移。 较强研究证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
乳腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123C>T (p.Arg41Ter) 无义突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
c.456G>A (p.Trp152Ter) 无义突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如无义突变导致蛋白截短,可能影响转录抑制功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003677 (DNA binding) • GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity)
• GO:0005634 (nucleus) • GO:0006355 (regulation of transcription
• DNA-templated)

相关通路

Epithelial to mesenchymal transition (EMT) pathway (Reactome: R-HSA-446353)

蛋白质功能简介

SCRT2蛋白属于Snail家族转录抑制因子,包含4个C2H2型锌指结构域,定位于细胞核,通过结合DNA调控基因转录。SCRT2在神经发育中可能参与神经嵴细胞的分化,在癌症中可能通过调控EMT促进肿瘤侵袭和转移。

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