SCRT2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SCRT2(Snail家族转录抑制因子2)在神经发育和癌症中发挥重要作用,其突变与神经发育障碍和肿瘤发生相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SCRT2 |
|---|---|
| 基因全名 | snail family transcriptional repressor 2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 20p13 |
| NCBI Gene ID | 84708 ncbi.nlm.nih.gov/gene/84708 |
| Ensembl ID | ENSG00000101210 |
| UniProt ID | Q9NQ03 |
| OMIM ID | 607779 |
| HGNC ID | 15951 |
| 基因别名 | ZNF898B, SCRT2, FLJ23356 |
基因功能与研究简介
SCRT2(Snail家族转录抑制因子2)属于Snail家族转录因子,包含锌指结构域,主要作为转录抑制因子参与调控基因表达。SCRT2在神经发育中发挥重要作用,可能参与神经嵴细胞的分化和迁移。此外,SCRT2在多种癌症中表达异常,与肿瘤的发生发展相关。研究表明,SCRT2可能通过调控上皮-间质转化(EMT)影响肿瘤侵袭和转移。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 神经发育障碍 | SCRT2突变可能导致神经发育异常,但具体机制尚不明确。 | 暂无明确证据 |
| 癌症 | SCRT2在多种癌症中表达异常,可能通过调控EMT促进肿瘤侵袭和转移。 | 较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123C>T (p.Arg41Ter) | 无义突变 | 罕见 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.456G>A (p.Trp152Ter) | 无义突变 | 罕见 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,如无义突变导致蛋白截短,可能影响转录抑制功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003677 (DNA binding) | • GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity) |
| • GO:0005634 (nucleus) | • GO:0006355 (regulation of transcription |
| • DNA-templated) |
相关通路
• Epithelial to mesenchymal transition (EMT) pathway (Reactome: R-HSA-446353)
蛋白质功能简介
SCRT2蛋白属于Snail家族转录抑制因子,包含4个C2H2型锌指结构域,定位于细胞核,通过结合DNA调控基因转录。SCRT2在神经发育中可能参与神经嵴细胞的分化,在癌症中可能通过调控EMT促进肿瘤侵袭和转移。