SDK2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SDK2(Sidekick Cell Adhesion Molecule 2)是一种编码细胞粘附分子的基因,在神经系统发育和突触形成中发挥重要作用,其突变可能与神经发育障碍相关。

基因信息卡

基因符号 SDK2
基因全名 Sidekick Cell Adhesion Molecule 2
基因类型 protein-coding
染色体位置 17q25.1
NCBI Gene ID 54549 ncbi.nlm.nih.gov/gene/54549
Ensembl ID ENSG00000108771
UniProt ID Q6UX06
OMIM ID 607964
HGNC ID 19369
基因别名 KIAA1514, FLJ12623

基因功能与研究简介

SDK2基因编码一种I型跨膜蛋白,属于免疫球蛋白超家族,包含多个免疫球蛋白样结构域和纤连蛋白III型结构域。该蛋白在神经系统中高表达,参与神经元突触粘附、突触形成和维持,对神经回路的正确建立至关重要。SDK2还可能在非神经组织中发挥一定作用,但其具体功能尚不完全清楚。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
精神分裂症 潜在关联:SDK2基因变异可能影响突触功能,增加精神分裂症风险。 暂无明确证据,需进一步研究
自闭症谱系障碍 潜在关联:SDK2参与突触形成,其突变可能影响神经发育,与自闭症相关。 暂无明确证据,需进一步研究

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Thr412Ala) SNV 罕见 可能影响蛋白结构,功能未知
c.4567C>T (p.Arg1523Ter) SNV 罕见 导致提前终止,可能引起无义突变介导的mRNA降解,导致功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变:如无义突变或移码突变导致蛋白截短或降解,使SDK2蛋白功能缺失,可能影响突触形成。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:目前暂无明确证据表明SDK2存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:目前暂无明确证据表明SDK2存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0007156 (homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules) • GO:0005886 (plasma membrane)
• GO:0005887 (integral component of plasma membrane) • GO:0007155 (cell adhesion)
• GO:0007399 (nervous system development) • GO:0045202 (synapse)

相关通路

暂无明确通路数据

蛋白质功能简介

SDK2蛋白是一种细胞粘附分子,属于免疫球蛋白超家族。它包含多个免疫球蛋白结构域和纤连蛋白III型结构域,通过同嗜性相互作用介导细胞间粘附。在神经系统中,SDK2定位于突触前膜和突触后膜,参与突触的形成和维持,对神经回路的精确连接至关重要。此外,SDK2还可能参与细胞迁移和分化过程。

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