SDR42E1基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究
SDR42E1(短链脱氢酶/还原酶家族42E1)是一种参与类固醇代谢的酶,其突变可能与遗传性皮肤病和类固醇代谢异常相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SDR42E1 |
|---|---|
| 基因全名 | short chain dehydrogenase/reductase family 42E, member 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 16q23.1 |
| NCBI Gene ID | 93589 ncbi.nlm.nih.gov/gene/93589 |
| Ensembl ID | ENSG00000140945 |
| UniProt ID | Q6ZN16 |
| OMIM ID | 暂无可靠数据 |
| HGNC ID | HGNC:28312 |
| 基因别名 | DKFZp686K23112, FLJ43855, MGC138499 |
基因功能与研究简介
SDR42E1基因编码短链脱氢酶/还原酶(SDR)家族成员,该酶参与类固醇代谢,可能涉及胆固醇和类固醇激素的生物合成。SDR42E1在多种组织中表达,尤其在皮肤和肾上腺中较高。研究表明,SDR42E1的突变与遗传性皮肤病(如鱼鳞病)相关,但具体机制尚需进一步研究。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 鱼鳞病(Ichthyosis) | SDR42E1突变可能导致类固醇代谢异常,影响皮肤屏障功能,与鱼鳞病相关。 | 较强研究证据 |
| 类固醇代谢异常 | SDR42E1参与类固醇代谢,其功能障碍可能影响类固醇激素合成。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 皮肤 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肾上腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| 角质形成细胞 | 暂无可靠数据 | 皮肤相关细胞 |
| 肾上腺皮质细胞 | 暂无可靠数据 | 类固醇合成细胞 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.457C>T (p.Arg153Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.104C>T (p.Pro35Leu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):无义突变导致蛋白截短,可能丧失酶活性。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0016491 oxidoreductase activity | • GO:0006694 steroid biosynthetic process |
| • GO:0005783 endoplasmic reticulum |
相关通路
• Steroid biosynthesis (KEGG: map00100)
蛋白质功能简介
SDR42E1蛋白属于短链脱氢酶/还原酶家族,定位于内质网,可能参与类固醇代谢。其具体底物和催化机制尚不完全清楚,但研究表明其参与胆固醇或类固醇激素的合成。