SDR42E1基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

SDR42E1(短链脱氢酶/还原酶家族42E1)是一种参与类固醇代谢的酶,其突变可能与遗传性皮肤病和类固醇代谢异常相关。

基因信息卡

基因符号 SDR42E1
基因全名 short chain dehydrogenase/reductase family 42E, member 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 16q23.1
NCBI Gene ID 93589 ncbi.nlm.nih.gov/gene/93589
Ensembl ID ENSG00000140945
UniProt ID Q6ZN16
OMIM ID 暂无可靠数据
HGNC ID HGNC:28312
基因别名 DKFZp686K23112, FLJ43855, MGC138499

基因功能与研究简介

SDR42E1基因编码短链脱氢酶/还原酶(SDR)家族成员,该酶参与类固醇代谢,可能涉及胆固醇和类固醇激素的生物合成。SDR42E1在多种组织中表达,尤其在皮肤和肾上腺中较高。研究表明,SDR42E1的突变与遗传性皮肤病(如鱼鳞病)相关,但具体机制尚需进一步研究。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
鱼鳞病(Ichthyosis) SDR42E1突变可能导致类固醇代谢异常,影响皮肤屏障功能,与鱼鳞病相关。 较强研究证据
类固醇代谢异常 SDR42E1参与类固醇代谢,其功能障碍可能影响类固醇激素合成。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
皮肤 暂无可靠数据 高表达
肾上腺 暂无可靠数据 中等表达
肝脏 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
角质形成细胞 暂无可靠数据 皮肤相关细胞
肾上腺皮质细胞 暂无可靠数据 类固醇合成细胞
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.457C>T (p.Arg153Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.104C>T (p.Pro35Leu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失):无义突变导致蛋白截短,可能丧失酶活性。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得):暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性):暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0016491 oxidoreductase activity • GO:0006694 steroid biosynthetic process
• GO:0005783 endoplasmic reticulum

相关通路

Steroid biosynthesis (KEGG: map00100)

蛋白质功能简介

SDR42E1蛋白属于短链脱氢酶/还原酶家族,定位于内质网,可能参与类固醇代谢。其具体底物和催化机制尚不完全清楚,但研究表明其参与胆固醇或类固醇激素的合成。

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