SEC23B基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SEC23B是COPII囊泡运输的关键组分,其突变导致先天性红细胞生成不良性贫血(CDAN2),并参与多种癌症的发生发展。

基因信息卡

基因符号 SEC23B
基因全名 SEC23 homolog B, COPII coat complex component
基因类型 protein-coding
染色体位置 20p11.23
NCBI Gene ID 10483 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10483
Ensembl ID ENSG00000101310
UniProt ID Q15437
OMIM ID 610512
HGNC ID 10702
基因别名 CDAN2, CDA-II, SEC23B variant

基因功能与研究简介

SEC23B基因编码COPII囊泡外壳蛋白复合物的一个组分,该复合物负责从内质网到高尔基体的蛋白质运输。SEC23B在红细胞生成中发挥重要作用,其突变可导致先天性红细胞生成不良性贫血II型(CDAN2)。此外,SEC23B的异常表达与多种癌症相关,可能参与肿瘤的发生和进展。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
先天性红细胞生成不良性贫血II型(CDAN2) SEC23B基因突变导致COPII囊泡运输功能障碍,影响红细胞成熟,导致贫血。 已明确致病
胰腺癌 SEC23B表达异常可能影响蛋白质分泌和细胞增殖,与胰腺癌的发生发展相关。 具有较强研究证据
结直肠癌 SEC23B在结直肠癌中表达下调,可能通过影响细胞外基质重塑促进肿瘤进展。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
骨髓 暂无可靠数据 高表达(红细胞前体)
肝脏 暂无可靠数据 中等表达
胰腺 暂无可靠数据 中等表达
结肠 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
K562 暂无可靠数据 人慢性粒细胞白血病细胞系
HepG2 暂无可靠数据 人肝癌细胞系
PANC-1 暂无可靠数据 人胰腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.325G>A (p.Gly109Arg) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.1075C>T (p.Arg359Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.1546C>T (p.Arg516Ter) 无义突变 罕见 导致截短蛋白,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

SEC23B突变导致蛋白功能丧失,影响COPII囊泡运输,是CDAN2的主要致病机制。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明SEC23B存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明SEC23B突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0006886 - intracellular protein transport • GO:0006888 - ER to Golgi vesicle-mediated transport
• GO:0030120 - vesicle coat • GO:0005515 - protein binding

相关通路

hsa04141 - Protein processing in endoplasmic reticulum
hsa04721 - Synaptic vesicle cycle

蛋白质功能简介

SEC23B蛋白是COPII囊泡外壳复合物的组成部分,与SEC24形成异二聚体,参与内质网出芽和囊泡形成。该蛋白在红细胞生成中至关重要,其突变导致红细胞成熟障碍。此外,SEC23B可能通过调节蛋白质分泌影响肿瘤微环境。

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