SEL1L3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SEL1L3是内质网相关蛋白降解(ERAD)途径的关键调控因子,与多种疾病和癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SEL1L3 |
|---|---|
| 基因全名 | SEL1L family member 3 |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 4p15.2 |
| NCBI Gene ID | 23231 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23231 |
| Ensembl ID | ENSG00000138668 |
| UniProt ID | Q8IZ83 |
| OMIM ID | 611206 |
| HGNC ID | 29115 |
| 基因别名 | SEL1L2, SEL1L3, dJ523O5.1 |
基因功能与研究简介
SEL1L3(SEL1L family member 3)是SEL1L蛋白家族的一员,编码一种含有多个WD40重复结构域的蛋白质。该蛋白是内质网相关蛋白降解(ERAD)途径的组成部分,参与错误折叠蛋白的识别和降解。SEL1L3在多种组织中表达,尤其在睾丸和胎盘中高表达。研究表明,SEL1L3可能参与蛋白质质量控制,并与某些癌症的发生发展相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症 | SEL1L3在多种癌症中表达异常,可能通过影响ERAD途径参与肿瘤发生发展。 | 较强研究证据 |
| 神经退行性疾病 | SEL1L3可能参与错误折叠蛋白的清除,与神经退行性疾病相关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 胎盘 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 其他组织 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Thr412Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.567delC (p.Leu190fs) | 移码突变 | 罕见 | 可能导致蛋白截短 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变可能导致SEL1L3蛋白功能丧失,影响ERAD途径,导致错误折叠蛋白积累。
Gain of Function(功能获得,GOF)
目前暂无明确证据表明SEL1L3存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
目前暂无明确证据表明SEL1L3存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005783 endoplasmic reticulum |
| • GO:0030433 ER-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process |
相关通路
• Endoplasmic reticulum-associated degradation (ERAD) pathway
蛋白质功能简介
SEL1L3蛋白含有WD40重复结构域,是ERAD途径的组成部分。它可能作为衔接蛋白,参与底物识别和降解。SEL1L3在多种组织中表达,尤其在睾丸和胎盘中高表达。研究表明,SEL1L3可能通过调控ERAD途径影响细胞蛋白质稳态,与癌症等疾病相关。