SELENOF基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SELENOF编码一种内质网定位的硒蛋白,参与氧化还原调控和蛋白质折叠,与多种癌症和神经退行性疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SELENOF |
|---|---|
| 基因全名 | Selenoprotein F |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1p22.3 |
| NCBI Gene ID | 6416 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6416 |
| Ensembl ID | ENSG00000162572 |
| UniProt ID | O60613 |
| OMIM ID | 607915 |
| HGNC ID | 10708 |
| 基因别名 | SELENOF, SEP15, 15 kDa selenoprotein |
基因功能与研究简介
SELENOF(硒蛋白F)是一种内质网(ER)定位的硒蛋白,含有硒代半胱氨酸(Sec)残基。它参与氧化还原调控和蛋白质折叠,可能通过其硫氧还蛋白样结构域发挥功能。SELENOF在多种组织中表达,尤其在肝脏、肾脏和睾丸中高表达。研究表明,SELENOF与多种癌症(如乳腺癌、前列腺癌)和神经退行性疾病(如阿尔茨海默病)相关,可能通过影响氧化应激和蛋白质稳态参与疾病发生。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 乳腺癌 | SELENOF表达下调与乳腺癌风险增加相关,可能通过影响氧化还原平衡和细胞增殖。 | 较强研究证据 |
| 前列腺癌 | SELENOF基因多态性与前列腺癌易感性相关,可能影响硒蛋白功能。 | 较强研究证据 |
| 阿尔茨海默病 | SELENOF在脑组织中表达,可能参与氧化应激和蛋白质错误折叠,与AD病理相关。 | 潜在关联 |
| 结直肠癌 | SELENOF表达异常与结直肠癌进展相关,但机制尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| PC3 | 暂无可靠数据 | 前列腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| rs5859 | SNP | 未知 | 可能影响SELENOF表达或功能,与癌症风险相关 |
| rs5845 | SNP | 未知 | 可能影响硒蛋白合成,与前列腺癌风险相关 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
SELENOF功能缺失可能导致氧化还原失衡和蛋白质错误折叠,增加疾病风险。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明SELENOF存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明SELENOF存在显性负效应突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005783 (endoplasmic reticulum) |
| • GO:0004601 (peroxidase activity) | • GO:0045454 (cell redox homeostasis) |
相关通路
• Pathway: hsa04213 (Longevity regulating pathway)
• Pathway: hsa04919 (Thyroid hormone signaling pathway)
蛋白质功能简介
SELENOF蛋白是一种内质网驻留的硒蛋白,含有硒代半胱氨酸(Sec)残基,具有硫氧还蛋白样结构域。它可能参与氧化还原调控和蛋白质折叠,通过清除活性氧(ROS)保护细胞免受氧化应激损伤。SELENOF在多种组织中表达,尤其在肝脏、肾脏和睾丸中高表达。研究表明,SELENOF与多种癌症和神经退行性疾病相关,可能通过影响氧化还原平衡和蛋白质稳态参与疾病发生。