SEMA3C基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SEMA3C(Semaphorin 3C)是神经导向和肿瘤微环境调控中的关键分泌型信号分子,参与多种癌症进展和神经系统发育。
基因信息卡
| 基因符号 | SEMA3C |
|---|---|
| 基因全名 | Semaphorin 3C |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 7q21.11 |
| NCBI Gene ID | 10512 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10512 |
| Ensembl ID | ENSG00000075223 |
| UniProt ID | Q99985 |
| OMIM ID | 602645 |
| HGNC ID | 10725 |
| 基因别名 | SEMAE, Semaphorin E |
基因功能与研究简介
SEMA3C(Semaphorin 3C)是Semaphorin家族的一员,编码一种分泌型信号蛋白,参与神经导向、血管生成和肿瘤进展。SEMA3C通过结合Neuropilin和Plexin受体,调控细胞骨架重塑和细胞迁移。在多种癌症中,SEMA3C表达上调,促进肿瘤侵袭和转移。此外,SEMA3C在心脏发育和神经系统发育中发挥重要作用。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症(多种类型) | SEMA3C在多种癌症中高表达,通过激活Plexin B1和c-Met信号通路促进肿瘤细胞增殖、迁移和侵袭,与不良预后相关。 | 较强研究证据 |
| 精神分裂症 | SEMA3C基因变异与精神分裂症风险相关,可能通过影响神经发育和突触形成。 | 潜在关联 |
| 先天性心脏病 | SEMA3C在心脏神经嵴细胞迁移中起作用,其异常可能导致心脏流出道畸形。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| HUVEC | 暂无可靠数据 | 内皮细胞 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| rs1110 | SNV | 暂无可靠数据 | 可能影响剪接 |
| c.1234A>G | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变可能导致SEMA3C蛋白活性降低,影响神经导向和血管生成,与发育异常相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变可能增强SEMA3C信号,促进肿瘤进展。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变可能干扰正常SEMA3C功能,影响细胞迁移。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0008009 (chemokine activity) | • GO:0007155 (cell adhesion) |
| • GO:0007411 (axon guidance) | • GO:0001525 (angiogenesis) |
| • GO:0005886 (plasma membrane) |
相关通路
• Axon guidance (hsa04360)
• Semaphorin interactions (R-HSA-373755)
蛋白质功能简介
SEMA3C蛋白属于Semaphorin家族,包含Sema结构域、PSI结构域和免疫球蛋白样结构域。作为分泌型蛋白,SEMA3C通过结合Neuropilin-1/2和Plexin B1受体,激活下游信号通路,调控细胞骨架重排和细胞迁移。在肿瘤微环境中,SEMA3C促进肿瘤血管生成和免疫逃逸。