SEMA4C基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SEMA4C(Semaphorin 4C)是信号素家族成员,参与神经发育、免疫调节及肿瘤进展,是癌症和神经系统疾病研究的重要靶点。
基因信息卡
| 基因符号 | SEMA4C |
|---|---|
| 基因全名 | semaphorin 4C |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 2q11.2 |
| NCBI Gene ID | 54910 ncbi.nlm.nih.gov/gene/54910 |
| Ensembl ID | ENSG00000142208 |
| UniProt ID | Q9C0C4 |
| OMIM ID | 608844 |
| HGNC ID | 10731 |
| 基因别名 | SEMACL1, Semaphorin-4C, M-SEMACL1 |
基因功能与研究简介
SEMA4C(Semaphorin 4C)是信号素(Semaphorin)家族成员,编码一种跨膜蛋白,参与多种生物学过程,包括神经发育、免疫调节和肿瘤进展。SEMA4C通过与其受体(如PLXNB2)结合,调节细胞迁移、增殖和分化。在神经系统中,SEMA4C参与轴突导向和突触形成;在免疫系统中,调节T细胞和B细胞的功能;在肿瘤中,SEMA4C的异常表达与多种癌症的侵袭和转移相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 乳腺癌 | SEMA4C过表达促进肿瘤细胞迁移和侵袭,与不良预后相关。 | 较强研究证据 |
| 肺癌 | SEMA4C在非小细胞肺癌中高表达,可能通过促进上皮-间质转化(EMT)参与肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | SEMA4C表达上调与肿瘤分期和淋巴结转移相关。 | 较强研究证据 |
| 神经发育障碍 | SEMA4C在神经发育中的作用提示其可能与某些神经发育障碍相关,但具体证据有限。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| MCF7 (乳腺癌细胞系) | 暂无可靠数据 | SEMA4C表达可能较高 |
| A549 (肺癌细胞系) | 暂无可靠数据 | SEMA4C表达可能较高 |
| HCT116 (结直肠癌细胞系) | 暂无可靠数据 | SEMA4C表达可能较高 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Thr412Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,但具体影响未知 |
| c.567C>T (p.Arg189Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,但功能影响未明确 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
暂无明确证据表明SEMA4C突变导致功能丧失。
Gain of Function(功能获得,GOF)
在肿瘤中,SEMA4C过表达可能表现为功能获得,但具体突变导致的功能获得证据不足。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明SEMA4C突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0007155 (cell adhesion) | • GO:0007411 (axon guidance) |
| • GO:0048018 (receptor ligand activity) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
相关通路
• Semaphorin interactions (Reactome: R-HSA-373755)
• Axon guidance (KEGG: hsa04360)
蛋白质功能简介
SEMA4C编码的蛋白是信号素家族成员,为跨膜蛋白,包含Sema结构域、PSI结构域和免疫球蛋白样结构域。该蛋白在多种组织中表达,尤其在神经系统中高表达。SEMA4C通过与受体PLXNB2结合,激活下游信号通路,调节细胞骨架重排和细胞迁移。在肿瘤中,SEMA4C的过表达促进肿瘤细胞的侵袭和转移,可能通过激活Rho家族GTP酶实现。