SEMA5B基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SEMA5B编码信号素家族成员,参与神经发育和免疫调节,其异常表达与多种癌症和神经发育障碍相关。

基因信息卡

基因符号 SEMA5B
基因全名 semaphorin 5B
基因类型 protein-coding
染色体位置 3q21.1
NCBI Gene ID 54437 ncbi.nlm.nih.gov/gene/54437
Ensembl ID ENSG00000182612
UniProt ID Q9P283
OMIM ID 609298
HGNC ID 10737
基因别名 Semaphorin-5B, FLJ10385, KIAA1445

基因功能与研究简介

SEMA5B基因编码信号素家族成员Semaphorin 5B,该蛋白在神经发育、轴突导向和免疫调节中发挥重要作用。SEMA5B通过其Sema结构域与受体结合,参与细胞信号传导,影响细胞迁移和增殖。研究表明,SEMA5B在多种肿瘤中表达异常,与肿瘤进展和预后相关。此外,SEMA5B的突变或表达失调可能与神经发育障碍有关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 SEMA5B突变可能影响轴突导向和神经元迁移,导致神经发育异常。 暂无明确证据,但基于功能研究推测
癌症 SEMA5B在多种癌症中表达上调或下调,可能通过调节细胞增殖、迁移和血管生成影响肿瘤进展。 多项研究报道,但具体机制尚待阐明
免疫相关疾病 SEMA5B参与免疫细胞调节,可能影响炎症反应和自身免疫疾病。 暂无明确证据,基于表达和功能研究

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用于异源表达
HeLa 暂无可靠数据 表达水平未知
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Thr412Ala) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,功能影响未知
c.2345delC (p.Pro782LeufsTer3) 移码突变 罕见 导致截短蛋白,可能丧失功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

移码突变导致截短蛋白,可能丧失功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0007155 (cell adhesion) • GO:0007411 (axon guidance)
• GO:0030215 (semaphorin receptor binding) • GO:0048843 (negative regulation of axon extension involved in axon guidance)

相关通路

Axon guidance (hsa04360)
Semaphorin interactions (R-HSA-373755)

蛋白质功能简介

Semaphorin 5B是一种跨膜蛋白,属于信号素家族。它包含Sema结构域、PSI结构域和免疫球蛋白样结构域。该蛋白在神经系统中高表达,参与轴突导向和神经元迁移。在免疫系统中,SEMA5B可能调节T细胞和B细胞的功能。此外,SEMA5B在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响细胞增殖和迁移参与肿瘤发生。

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