SEPTIN4基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SEPTIN4编码细胞分裂和凋亡调控相关的septin家族蛋白,参与多种细胞过程,与神经发育和肿瘤发生相关。

基因信息卡

基因符号 SEPTIN4
基因全名 septin 4
基因类型 protein-coding
染色体位置 17q22
NCBI Gene ID 5414 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5414
Ensembl ID ENSG00000108384
UniProt ID O43236
OMIM ID 603696
HGNC ID 10716
基因别名 SEPT4, hCDCREL-2, MART, ARTS, PNUTL2

基因功能与研究简介

SEPTIN4(septin 4)是septin家族成员之一,编码的蛋白质参与细胞分裂、胞质分裂、细胞凋亡和囊泡运输等过程。SEPTIN4在多种组织中表达,尤其在脑和睾丸中高表达。该基因的异常表达或突变与多种疾病相关,包括神经发育异常和肿瘤。研究表明,SEPTIN4在凋亡调控中发挥重要作用,其剪接变体ARTS(apoptosis-related protein in the TGF-beta signaling pathway)可促进细胞凋亡。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
急性淋巴细胞白血病 SEPTIN4剪接变体ARTS表达下调,导致凋亡抑制,促进白血病发生 较强研究证据
结直肠癌 SEPTIN4表达下调,与肿瘤进展和不良预后相关 较强研究证据
帕金森病 SEPTIN4在神经细胞中参与凋亡调控,可能参与帕金森病的发病机制 潜在关联
精神分裂症 SEPTIN4基因变异与精神分裂症风险相关 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
肝脏 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123C>T (p.Arg41Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.456_457insA (p.Thr153AsnfsTer2) 移码突变 罕见 Loss of Function
c.789G>A (p.Trp263Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变,导致SEPTIN4蛋白功能丧失或截短,可能影响凋亡调控和细胞分裂。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0005829 (cytosol) • GO:0006915 (apoptotic process)
• GO:0007049 (cell cycle) • GO:0016020 (membrane)
• GO:0032153 (cell division site) • GO:0042802 (identical protein binding)

相关通路

Apoptosis (KEGG: hsa04210)
TGF-beta signaling pathway (KEGG: hsa04350)

蛋白质功能简介

SEPTIN4蛋白属于septin家族,包含GTPase结构域,能够结合GTP/GDP,参与细胞分裂和胞质分裂。SEPTIN4在凋亡调控中具有双重作用:全长蛋白可能抑制凋亡,而剪接变体ARTS则促进凋亡。ARTS通过结合XIAP并抑制其抗凋亡活性,从而激活caspase。SEPTIN4在多种肿瘤中表达下调,提示其可能作为肿瘤抑制因子。

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