SEPTIN5基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SEPTIN5编码的septin蛋白参与细胞分裂、囊泡运输和神经递质释放,其异常与神经发育障碍和肿瘤相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SEPTIN5 |
|---|---|
| 基因全名 | septin 5 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 22q11.21 |
| NCBI Gene ID | 5413 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5413 |
| Ensembl ID | ENSG00000100220 |
| UniProt ID | Q99719 |
| OMIM ID | 602678 |
| HGNC ID | 10799 |
| 基因别名 | CDCrel-1, H5, PNUTL2 |
基因功能与研究简介
SEPTIN5(septin 5)属于septin家族,编码的蛋白质参与细胞分裂、胞质分裂、囊泡运输和神经递质释放等过程。该基因位于染色体22q11.21区域,该区域与多种神经发育疾病相关。SEPTIN5在脑组织中高表达,尤其在神经元中,可能参与突触囊泡的调控。研究表明,SEPTIN5的异常表达或突变可能与神经发育障碍、精神分裂症和某些癌症相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 神经发育障碍 | SEPTIN5基因突变可能导致septin蛋白功能异常,影响神经元迁移和突触形成,与神经发育障碍相关。 | ClinVar, OMIM |
| 精神分裂症 | SEPTIN5位于22q11.2缺失综合征区域,该区域缺失与精神分裂症风险增加相关,SEPTIN5可能参与其中。 | OMIM, PubMed |
| 癌症 | SEPTIN5在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响细胞分裂和凋亡参与肿瘤发生发展。 | COSMIC, PubMed |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.100C>T (p.Arg34Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,与神经发育障碍相关 |
| c.200del (p.Gly67Alafs*23) | 移码突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,可能为功能丧失突变 |
| c.300G>A (p.Met100Ile) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失突变,如移码突变导致蛋白截短,可能影响septin蛋白的正常功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005524 ATP binding |
| • GO:0005737 cytoplasm | • GO:0005815 microtubule organizing center |
| • GO:0005886 plasma membrane | • GO:0016020 membrane |
| • GO:0030054 cell junction | • GO:0030424 axon |
| • GO:0030425 dendrite | • GO:0045202 synapse |
| • GO:0007268 chemical synaptic transmission | • GO:0006897 endocytosis |
| • GO:0006906 vesicle fusion | • GO:0016079 synaptic vesicle exocytosis |
| • GO:0000910 cytokinesis | • GO:0007059 chromosome segregation |
| • GO:0007010 cytoskeleton organization |
相关通路
• hsa04144: Endocytosis
• hsa04721: Synaptic vesicle cycle
• hsa04110: Cell cycle
蛋白质功能简介
SEPTIN5蛋白属于septin家族,具有GTPase活性,能够结合GTP/GDP,参与细胞分裂、胞质分裂、囊泡运输和神经递质释放。该蛋白在脑组织中高表达,尤其在神经元中,可能通过形成丝状结构参与突触囊泡的锚定和融合。SEPTIN5的异常表达或突变可能影响神经元的正常功能,与神经发育障碍和神经退行性疾病相关。此外,SEPTIN5在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控细胞周期和凋亡参与肿瘤发生。