SEPTIN7基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SEPTIN7是septin家族成员,参与细胞分裂、胞质分裂和膜动力学,与神经发育和肿瘤发生相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SEPTIN7 |
|---|---|
| 基因全名 | septin 7 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 7p14.2 |
| NCBI Gene ID | 989 ncbi.nlm.nih.gov/gene/989 |
| Ensembl ID | ENSG00000122545 |
| UniProt ID | Q16181 |
| OMIM ID | 603696 |
| HGNC ID | 1717 |
| 基因别名 | CDC10, SEPT7, MGC1661 |
基因功能与研究简介
SEPTIN7(septin 7)是septin蛋白家族的成员,该家族在真核生物中高度保守,参与细胞分裂、胞质分裂、细胞极性、膜动力学和囊泡运输等过程。SEPTIN7是septin复合物的核心组分,通常与其他septin蛋白形成异聚体。研究表明,SEPTIN7在神经发育中发挥重要作用,其突变或表达异常与神经发育障碍和某些癌症相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 神经发育障碍 | SEPTIN7突变可能导致神经发育异常,影响神经元迁移和突触形成。 | ClinVar中有致病性变异记录,但证据有限。 |
| 胶质母细胞瘤 | SEPTIN7表达异常可能影响细胞分裂和肿瘤抑制功能。 | 部分研究显示SEPTIN7在胶质母细胞瘤中表达下调,但证据尚不充分。 |
| 肝细胞癌 | SEPTIN7可能参与肝癌的发生发展,但具体机制尚不明确。 | 有研究报道SEPTIN7在肝细胞癌中表达异常,但证据等级较低。 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1135C>T (p.Arg379Ter) | 无义突变 | 罕见 | 可能导致蛋白截短,功能丧失。 |
| c.1045A>G (p.Thr349Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,功能影响未知。 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变导致蛋白截短,可能引起功能丧失。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0005813 (centrosome) | • GO:0005819 (spindle) |
| • GO:0005829 (cytosol) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
| • GO:0005938 (cell cortex) | • GO:0016020 (membrane) |
| • GO:0030496 (midbody) | • GO:0032153 (cell division site) |
| • GO:0045121 (membrane raft) | • GO:0072686 (mitotic spindle) |
相关通路
• hsa04110 (Cell cycle)
• hsa04810 (Regulation of actin cytoskeleton)
• hsa05165 (Human papillomavirus infection)
蛋白质功能简介
SEPTIN7蛋白属于septin家族,包含一个GTPase结构域,能够结合GTP/GDP,参与septin复合物的组装。该蛋白在细胞分裂过程中定位于分裂沟,参与胞质分裂的完成。此外,SEPTIN7还参与神经元的成熟和突触形成。其表达异常与多种疾病相关,但具体机制仍需进一步研究。