SERBP1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SERBP1(SERPINE1 mRNA结合蛋白1)是一种RNA结合蛋白,参与mRNA稳定性调控、细胞应激反应和肿瘤发生,是癌症研究的重要靶点。
基因信息卡
| 基因符号 | SERBP1 |
|---|---|
| 基因全名 | SERPINE1 mRNA binding protein 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1p31.3 |
| NCBI Gene ID | 26135 ncbi.nlm.nih.gov/gene/26135 |
| Ensembl ID | ENSG00000142871 |
| UniProt ID | Q8NC51 |
| OMIM ID | 608512 |
| HGNC ID | 17860 |
| 基因别名 | PAI-RBP1, CHD3IP, CGI-55, DKFZp586H2122 |
基因功能与研究简介
SERBP1(SERPINE1 mRNA结合蛋白1)是一种RNA结合蛋白,属于RGG(Arg-Gly-Gly)重复蛋白家族。它通过结合mRNA的3'UTR区域调控靶基因的稳定性,参与多种细胞过程,包括细胞增殖、凋亡、应激反应和肿瘤发生。SERBP1在多种癌症中高表达,与肿瘤进展和不良预后相关。此外,SERBP1还参与调控SERPINE1(PAI-1)的mRNA稳定性,影响纤溶系统和血管生成。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症(多种类型) | SERBP1在多种癌症中高表达,通过调控靶基因mRNA稳定性促进肿瘤细胞增殖、迁移和侵袭。 | 较强研究证据 |
| 子宫内膜癌 | SERBP1高表达与子宫内膜癌的侵袭性和不良预后相关。 | 研究证据 |
| 结直肠癌 | SERBP1在结直肠癌中表达上调,可能通过调控细胞周期相关基因促进肿瘤进展。 | 研究证据 |
| 胶质瘤 | SERBP1在胶质瘤中高表达,与肿瘤分级和患者生存期相关。 | 研究证据 |
| 肝细胞癌 | SERBP1在肝细胞癌中表达升高,可能通过影响EMT促进转移。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123A>G (p.Ile41Met) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白功能,但具体影响未知 |
| c.456C>T (p.Ser152Leu) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响RNA结合能力 |
| c.789delC (p.Pro263fs) | 移码突变 | 暂无可靠数据 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变可能导致SERBP1蛋白表达减少或功能缺失,影响mRNA稳定性调控,可能参与疾病发生。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变可能增强SERBP1的RNA结合能力或稳定性,导致靶基因表达异常,促进肿瘤进展。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变可能产生干扰正常SERBP1功能的蛋白,影响其调控网络。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003723 RNA binding | • GO:0005737 cytoplasm |
| • GO:0005634 nucleus | • GO:0017148 negative regulation of translation |
| • GO:0006417 regulation of translation | • GO:0048025 negative regulation of mRNA splicing |
| • via spliceosome |
相关通路
• hsa03018 RNA degradation
• hsa04141 Protein processing in endoplasmic reticulum
• hsa05200 Pathways in cancer
蛋白质功能简介
SERBP1蛋白由366个氨基酸组成,分子量约40 kDa。它包含一个RGG RNA结合结构域,能够结合富含AU的RNA序列。SERBP1主要定位于细胞质和细胞核,参与mRNA的稳定性调控和翻译调控。在应激条件下,SERBP1可被磷酸化修饰,影响其功能。SERBP1与多种蛋白相互作用,包括CHD3和PAI-1 mRNA,参与基因表达调控和细胞应激反应。