SERF1A基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SERF1A基因编码一种参与蛋白质聚集和细胞应激反应的小分子蛋白,与脊髓性肌萎缩症(SMA)的修饰基因相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SERF1A |
|---|---|
| 基因全名 | small EDRK-rich factor 1A |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 5q13.2 |
| NCBI Gene ID | 8293 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8293 |
| Ensembl ID | ENSG00000172062 |
| UniProt ID | O75920 |
| OMIM ID | 603011 |
| HGNC ID | 10754 |
| 基因别名 | SERF1, H4F5, SMAD4IP1 |
基因功能与研究简介
SERF1A(small EDRK-rich factor 1A)基因位于染色体5q13.2,编码一种富含EDRK(谷氨酸-天冬氨酸-精氨酸-赖氨酸)序列的小分子蛋白。该蛋白在细胞中参与蛋白质聚集的调控,特别是在poly-Q(多聚谷氨酰胺)和poly-A(多聚丙氨酸)扩展蛋白的聚集过程中发挥作用。SERF1A还与SMN1基因相邻,其拷贝数变异与脊髓性肌萎缩症(SMA)的严重程度相关,但SERF1A本身并不直接导致SMA,而是作为修饰因子影响疾病表型。此外,SERF1A在细胞应激反应中可能具有保护作用。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 脊髓性肌萎缩症(SMA) | SERF1A基因拷贝数变异与SMA严重程度相关,可能通过影响SMN1基因表达或蛋白质聚集过程修饰疾病表型。 | 较强研究证据 |
| 癌症 | 暂无明确证据表明SERF1A直接参与癌症发生,但可能通过调控蛋白质聚集影响肿瘤相关蛋白的稳态。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| 拷贝数变异(CNV) | 拷贝数变异 | 在SMA患者中常见 | 可能影响SMN1表达或SERF1A自身功能,导致疾病修饰作用 |
| 单核苷酸多态性(SNP) | SNP | 暂无可靠数据 | 暂无明确功能影响 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
SERF1A功能缺失可能影响蛋白质聚集调控,但具体表型尚不明确。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0005634 (nucleus) | • GO:0042802 (identical protein binding) |
相关通路
• 暂无明确Pathway ID
蛋白质功能简介
SERF1A蛋白由62个氨基酸组成,富含谷氨酸(E)、天冬氨酸(D)、精氨酸(R)和赖氨酸(K)残基。该蛋白在体外和体内均能促进蛋白质聚集,特别是对poly-Q和poly-A扩展蛋白的聚集具有促进作用。SERF1A可能通过改变蛋白质构象或促进错误折叠蛋白的聚集来参与细胞应激反应。此外,SERF1A与SMN1基因相邻,其拷贝数变异可能影响SMN1的表达,从而影响SMA的严重程度。