SERPINF1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SERPINF1基因编码色素上皮衍生因子(PEDF),在神经保护、抗血管生成和骨代谢中发挥关键作用,其突变可导致骨硬化症。
基因信息卡
| 基因符号 | SERPINF1 |
|---|---|
| 基因全名 | serpin family F member 1 |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 17p13.3 |
| NCBI Gene ID | 5176 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5176 |
| Ensembl ID | ENSG00000132386 |
| UniProt ID | P36955 |
| OMIM ID | 172860 |
| HGNC ID | 8824 |
| 基因别名 | PEDF, EPC-1, PIG35 |
基因功能与研究简介
SERPINF1基因编码色素上皮衍生因子(PEDF),属于丝氨酸蛋白酶抑制剂家族,但缺乏蛋白酶抑制活性。PEDF具有多种生物学功能,包括神经营养、抗血管生成、抗肿瘤和骨保护作用。在骨骼中,PEDF通过抑制破骨细胞分化和促进成骨细胞分化来维持骨量。SERPINF1基因突变可导致常染色体隐性遗传的骨硬化症(Osteogenesis imperfecta type VI)。此外,PEDF在多种癌症中表达下调,与肿瘤血管生成和转移相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 骨硬化症VI型 | SERPINF1基因功能缺失突变导致PEDF蛋白功能丧失,影响骨基质矿化和骨重塑,导致骨脆性增加和骨硬化症。 | 已明确致病(OMIM 613982) |
| 癌症 | PEDF具有抗血管生成和抗肿瘤作用,其表达下调与多种癌症的进展和不良预后相关。 | 具有较强研究证据(PMID: 12676921等) |
| 糖尿病视网膜病变 | PEDF具有神经保护作用,其水平变化与糖尿病视网膜病变的进展相关。 | 潜在关联(PMID: 16988021) |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脂肪组织 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| U2OS | 暂无可靠数据 | 骨肉瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1093C>T (p.Arg365Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1358dup (p.Gln454ProfsTer24) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.857G>A (p.Trp286Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变,导致PEDF蛋白截短或降解,丧失其正常功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004867 (serine protease inhibitor activity) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005615 (extracellular space) | • GO:0002020 (protease binding) |
| • GO:0043066 (negative regulation of apoptotic process) | • GO:0016525 (negative regulation of angiogenesis) |
| • GO:0001503 (ossification) |
相关通路
• hsa04510 (Focal adhesion)
• hsa04068 (FoxO signaling pathway)
• hsa05200 (Pathways in cancer)
蛋白质功能简介
PEDF是一种分泌性糖蛋白,属于丝氨酸蛋白酶抑制剂家族,但缺乏蛋白酶抑制活性。其结构包含一个信号肽和一个保守的丝氨酸蛋白酶抑制剂样结构域。PEDF具有多种功能:神经营养、抗血管生成、抗肿瘤、抗炎和骨保护。在骨骼中,PEDF通过抑制破骨细胞分化和促进成骨细胞分化来维持骨量。PEDF通过与多种受体(如PNPLA2、LRP6等)相互作用发挥其功能。