SERPINF1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SERPINF1基因编码色素上皮衍生因子(PEDF),在神经保护、抗血管生成和骨代谢中发挥关键作用,其突变可导致骨硬化症。

基因信息卡

基因符号 SERPINF1
基因全名 serpin family F member 1
基因类型 protein coding
染色体位置 17p13.3
NCBI Gene ID 5176 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5176
Ensembl ID ENSG00000132386
UniProt ID P36955
OMIM ID 172860
HGNC ID 8824
基因别名 PEDF, EPC-1, PIG35

基因功能与研究简介

SERPINF1基因编码色素上皮衍生因子(PEDF),属于丝氨酸蛋白酶抑制剂家族,但缺乏蛋白酶抑制活性。PEDF具有多种生物学功能,包括神经营养、抗血管生成、抗肿瘤和骨保护作用。在骨骼中,PEDF通过抑制破骨细胞分化和促进成骨细胞分化来维持骨量。SERPINF1基因突变可导致常染色体隐性遗传的骨硬化症(Osteogenesis imperfecta type VI)。此外,PEDF在多种癌症中表达下调,与肿瘤血管生成和转移相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
骨硬化症VI型 SERPINF1基因功能缺失突变导致PEDF蛋白功能丧失,影响骨基质矿化和骨重塑,导致骨脆性增加和骨硬化症。 已明确致病(OMIM 613982)
癌症 PEDF具有抗血管生成和抗肿瘤作用,其表达下调与多种癌症的进展和不良预后相关。 具有较强研究证据(PMID: 12676921等)
糖尿病视网膜病变 PEDF具有神经保护作用,其水平变化与糖尿病视网膜病变的进展相关。 潜在关联(PMID: 16988021)

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
脂肪组织 暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨骼肌 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
U2OS 暂无可靠数据 骨肉瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1093C>T (p.Arg365Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1358dup (p.Gln454ProfsTer24) 移码突变 罕见 Loss of Function
c.857G>A (p.Trp286Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变,导致PEDF蛋白截短或降解,丧失其正常功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004867 (serine protease inhibitor activity) • GO:0005515 (protein binding)
• GO:0005615 (extracellular space) • GO:0002020 (protease binding)
• GO:0043066 (negative regulation of apoptotic process) • GO:0016525 (negative regulation of angiogenesis)
• GO:0001503 (ossification)

相关通路

hsa04510 (Focal adhesion)
hsa04068 (FoxO signaling pathway)
hsa05200 (Pathways in cancer)

蛋白质功能简介

PEDF是一种分泌性糖蛋白,属于丝氨酸蛋白酶抑制剂家族,但缺乏蛋白酶抑制活性。其结构包含一个信号肽和一个保守的丝氨酸蛋白酶抑制剂样结构域。PEDF具有多种功能:神经营养、抗血管生成、抗肿瘤、抗炎和骨保护。在骨骼中,PEDF通过抑制破骨细胞分化和促进成骨细胞分化来维持骨量。PEDF通过与多种受体(如PNPLA2、LRP6等)相互作用发挥其功能。

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