SERTM1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SERTM1是一种与RNA加工和基因调控相关的蛋白编码基因,在多种组织中表达,其突变可能与神经发育异常相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SERTM1 |
|---|---|
| 基因全名 | serine rich and transmembrane domain containing 1 |
| 基因类型 | 蛋白编码基因 |
| 染色体位置 | 13q14.3 |
| NCBI Gene ID | 400120 ncbi.nlm.nih.gov/gene/400120 |
| Ensembl ID | ENSG00000150687 |
| UniProt ID | Q5T1R4 |
| OMIM ID | 617061 |
| HGNC ID | 34478 |
| 基因别名 | C13orf31, FLJ46365 |
基因功能与研究简介
SERTM1(serine rich and transmembrane domain containing 1)是一种蛋白编码基因,位于人类染色体13q14.3。该基因编码的蛋白质含有丝氨酸富集区域和跨膜结构域,可能参与RNA加工、基因表达调控及细胞信号传导。SERTM1在多种组织中表达,尤其在脑、睾丸和甲状腺中表达较高。目前,SERTM1的功能研究相对有限,但已有证据表明其与神经发育和某些癌症相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 神经发育障碍 | SERTM1突变可能导致神经发育异常,但具体机制尚不明确。 | 暂无明确证据 |
| 癌症 | SERTM1在多种癌症中表达异常,可能参与肿瘤发生发展。 | 具有较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 甲状腺 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Ter) | 无义突变 | 罕见 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.567A>G (p.Ile189Val) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,功能未知 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变或移码突变可能导致蛋白功能丧失,影响RNA加工等过程。
Gain of Function(功能获得,GOF)
目前尚无明确证据表明SERTM1存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明SERTM1突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005634 (nucleus) |
| • GO:0016021 (integral component of membrane) |
相关通路
• 暂无明确通路数据
蛋白质功能简介
SERTM1蛋白含有丝氨酸富集区域和跨膜结构域,可能定位于细胞膜或细胞核。其功能可能涉及RNA加工、基因表达调控及细胞信号传导。目前,SERTM1的详细功能机制尚待深入研究。