SETD5基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SETD5编码一种SET结构域蛋白,参与基因转录调控和染色质修饰,其突变与神经发育障碍和智力障碍密切相关。

基因信息卡

基因符号 SETD5
基因全名 SET domain containing 5
基因类型 protein-coding
染色体位置 3p25.3
NCBI Gene ID 55208 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55208
Ensembl ID ENSG00000168172
UniProt ID Q9C0A6
OMIM ID 615743
HGNC ID 25531
基因别名 KIAA1753

基因功能与研究简介

SETD5基因编码一种含有SET结构域的蛋白质,该蛋白参与基因转录调控和染色质修饰。SETD5在神经发育中发挥重要作用,其突变与常染色体显性遗传的智力障碍和自闭症谱系障碍相关。SETD5通过调节组蛋白甲基化等表观遗传机制影响基因表达,进而影响神经元功能。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
常染色体显性智力障碍23型 SETD5基因突变导致单倍剂量不足,影响神经发育相关基因的表达,从而引起智力障碍。 已明确致病
自闭症谱系障碍 SETD5突变与自闭症风险增加相关,可能通过影响突触功能和神经环路形成。 具有较强研究证据
发育迟缓 SETD5突变患者常表现为发育迟缓,包括运动和语言发育延迟。 已明确致病

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1096C>T (p.Arg366*) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1540delC (p.Leu514Trpfs*3) 移码突变 罕见 Loss of Function
c.1A>G (p.Met1?) 起始密码子突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

SETD5突变导致功能丧失,包括无义突变、移码突变等,导致蛋白质截短或降解,引起单倍剂量不足。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明SETD5存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明SETD5突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0006325 (chromatin organization) • GO:0006355 (regulation of transcription
• DNA-templated) • GO:0042802 (identical protein binding)

相关通路

暂无明确Pathway ID

蛋白质功能简介

SETD5蛋白含有SET结构域,可能具有组蛋白甲基转移酶活性,但具体催化活性尚未完全明确。该蛋白定位于细胞核,参与基因转录调控和染色质重塑。SETD5通过与多种蛋白相互作用,影响神经发育相关基因的表达。

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