SF3A1基因|基因功能、疾病关联、突变与剪接体研究

SF3A1是剪接体SF3a复合物的核心亚基,参与前体mRNA剪接,其突变与血液系统恶性肿瘤及癌症相关。

基因信息卡

基因符号 SF3A1
基因全名 Splicing Factor 3a Subunit 1
基因类型 蛋白编码基因
染色体位置 22q12.2
NCBI Gene ID 10291 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10291
Ensembl ID ENSG00000128274
UniProt ID Q15459
OMIM ID 605986
HGNC ID 10765
基因别名 PRP21, SAP114, SF3a120

基因功能与研究简介

SF3A1基因编码剪接体SF3a复合物的一个亚基,该复合物是U2 snRNP的组成部分,在pre-mRNA剪接的早期识别分支点序列中起关键作用。SF3A1蛋白包含一个锌指结构域和多个蛋白相互作用区域,参与剪接体的组装和剪接位点的选择。SF3A1在多种组织中广泛表达,其功能异常与血液系统恶性肿瘤和实体瘤的发生发展密切相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
骨髓增生异常综合征 SF3A1突变导致剪接异常,影响造血细胞分化,与MDS发病相关。 较强研究证据
急性髓系白血病 SF3A1突变在AML中检出,可能通过异常剪接促进白血病发生。 较强研究证据
慢性淋巴细胞白血病 SF3A1突变在CLL中罕见但存在,可能参与疾病进展。 潜在关联
多种实体瘤 SF3A1表达异常或突变在多种癌症中被报道,但具体机制尚待阐明。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
骨髓 暂无可靠数据 高表达(根据GTEx)
淋巴结 暂无可靠数据 高表达
脾脏 暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
K562 暂无可靠数据 白血病细胞系
HL-60 暂无可靠数据 白血病细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1284A>G (p.Ile428Met) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.1573C>T (p.Arg525Trp) 错义突变 罕见 可能影响剪接体组装
c.2140A>G (p.Ser714Gly) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

导致SF3A1蛋白功能丧失或剪接活性降低,可能通过单倍剂量不足或显性负效应影响剪接。

Gain of Function(功能获得,GOF)

目前尚无明确证据表明SF3A1突变具有功能获得效应。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

部分突变可能干扰SF3a复合物的组装,从而对野生型蛋白产生显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005681 • GO:0000398
• GO:0003723 • GO:0005634

相关通路

Spliceosome (hsa03040)
mRNA surveillance pathway (hsa03015)

蛋白质功能简介

SF3A1蛋白是剪接体SF3a复合物的亚基之一,分子量约120 kDa。该蛋白包含一个N端的锌指结构域和多个蛋白相互作用区域,参与U2 snRNP与pre-mRNA分支点的结合。SF3A1在剪接体组装中发挥关键作用,其功能异常可导致pre-mRNA剪接异常,进而影响基因表达和细胞功能。

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