SF3A1基因|基因功能、疾病关联、突变与剪接体研究
SF3A1是剪接体SF3a复合物的核心亚基,参与前体mRNA剪接,其突变与血液系统恶性肿瘤及癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SF3A1 |
|---|---|
| 基因全名 | Splicing Factor 3a Subunit 1 |
| 基因类型 | 蛋白编码基因 |
| 染色体位置 | 22q12.2 |
| NCBI Gene ID | 10291 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10291 |
| Ensembl ID | ENSG00000128274 |
| UniProt ID | Q15459 |
| OMIM ID | 605986 |
| HGNC ID | 10765 |
| 基因别名 | PRP21, SAP114, SF3a120 |
基因功能与研究简介
SF3A1基因编码剪接体SF3a复合物的一个亚基,该复合物是U2 snRNP的组成部分,在pre-mRNA剪接的早期识别分支点序列中起关键作用。SF3A1蛋白包含一个锌指结构域和多个蛋白相互作用区域,参与剪接体的组装和剪接位点的选择。SF3A1在多种组织中广泛表达,其功能异常与血液系统恶性肿瘤和实体瘤的发生发展密切相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 骨髓增生异常综合征 | SF3A1突变导致剪接异常,影响造血细胞分化,与MDS发病相关。 | 较强研究证据 |
| 急性髓系白血病 | SF3A1突变在AML中检出,可能通过异常剪接促进白血病发生。 | 较强研究证据 |
| 慢性淋巴细胞白血病 | SF3A1突变在CLL中罕见但存在,可能参与疾病进展。 | 潜在关联 |
| 多种实体瘤 | SF3A1表达异常或突变在多种癌症中被报道,但具体机制尚待阐明。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 高表达(根据GTEx) |
| 淋巴结 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| K562 | 暂无可靠数据 | 白血病细胞系 |
| HL-60 | 暂无可靠数据 | 白血病细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1284A>G (p.Ile428Met) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.1573C>T (p.Arg525Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响剪接体组装 |
| c.2140A>G (p.Ser714Gly) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
导致SF3A1蛋白功能丧失或剪接活性降低,可能通过单倍剂量不足或显性负效应影响剪接。
Gain of Function(功能获得,GOF)
目前尚无明确证据表明SF3A1突变具有功能获得效应。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
部分突变可能干扰SF3a复合物的组装,从而对野生型蛋白产生显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005681 | • GO:0000398 |
| • GO:0003723 | • GO:0005634 |
相关通路
• Spliceosome (hsa03040)
• mRNA surveillance pathway (hsa03015)
蛋白质功能简介
SF3A1蛋白是剪接体SF3a复合物的亚基之一,分子量约120 kDa。该蛋白包含一个N端的锌指结构域和多个蛋白相互作用区域,参与U2 snRNP与pre-mRNA分支点的结合。SF3A1在剪接体组装中发挥关键作用,其功能异常可导致pre-mRNA剪接异常,进而影响基因表达和细胞功能。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
|---|