SF3A3基因|基因功能、疾病关联、突变与剪接体研究

SF3A3是剪接体SF3a复合物的核心亚基,参与前体mRNA剪接,其突变与血液系统疾病及癌症相关。

基因信息卡

基因符号 SF3A3
基因全名 Splicing Factor 3a Subunit 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 1p34.3
NCBI Gene ID 10946 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10946
Ensembl ID ENSG00000116285
UniProt ID Q12874
OMIM ID 605599
HGNC ID 10767
基因别名 PRP9, SAP61, SF3a60

基因功能与研究简介

SF3A3基因编码剪接体SF3a复合物的一个亚基,该复合物是U2 snRNP的组成部分,在pre-mRNA剪接的早期识别分支点序列中起关键作用。SF3A3蛋白包含一个锌指结构域和一个泛素样结构域,参与蛋白质-蛋白质相互作用。SF3A3在多种组织中广泛表达,其功能异常与血液系统疾病和某些癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
骨髓增生异常综合征 SF3A3突变可能影响剪接体功能,导致异常剪接,与MDS发病相关。 ClinVar
急性髓系白血病 SF3A3突变在AML中偶见,可能通过剪接异常促进白血病发生。 COSMIC
慢性淋巴细胞白血病 SF3A3表达异常可能与CLL的进展有关。 COSMIC
癌症(泛癌) SF3A3在多种肿瘤中表达上调,可能作为预后标志物。 COSMIC

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 高表达
骨髓 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
K562 暂无可靠数据 白血病细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1072C>T (p.Arg358Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.1285A>G (p.Ser429Gly) 错义突变 罕见 可能影响剪接体组装
c.1570C>T (p.Arg524Ter) 无义突变 罕见 导致截短蛋白,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

无义突变或移码突变导致蛋白截短或降解,使SF3A3功能丧失,影响剪接体正常组装。

Gain of Function(功能获得,GOF)

目前暂无明确证据表明SF3A3突变具有功能获得性。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

某些错义突变可能产生异常蛋白,干扰正常SF3a复合物功能,具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005681 • GO:0000398
• GO:0000245 • GO:0005634
• GO:0003723

相关通路

hsa03040
hsa03041

蛋白质功能简介

SF3A3蛋白是剪接体SF3a复合物的亚基,包含一个锌指结构域和一个泛素样结构域。它参与pre-mRNA剪接的早期步骤,识别分支点序列并协助U2 snRNP组装。SF3A3在细胞核中定位,与多种剪接因子相互作用。其表达水平在多种肿瘤中上调,可能通过影响剪接调控肿瘤发生。

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