SF3B5基因|基因功能、疾病关联、突变与剪接体研究

SF3B5是剪接体SF3b复合物的核心亚基,参与前体mRNA剪接,其突变与血液系统疾病及癌症相关。

基因信息卡

基因符号 SF3B5
基因全名 Splicing Factor 3b Subunit 5
基因类型 蛋白编码基因
染色体位置 6q24.2
NCBI Gene ID 83443 ncbi.nlm.nih.gov/gene/83443
Ensembl ID ENSG00000112210
UniProt ID Q9BWJ5
OMIM ID 617847
HGNC ID 21071
基因别名 SF3b10, MGC14226

基因功能与研究简介

SF3B5(Splicing Factor 3b Subunit 5)是剪接体SF3b复合物的一个亚基,该复合物是U2 snRNP的组成部分,在pre-mRNA剪接的早期识别分支点序列中发挥关键作用。SF3B5通过与SF3B1、SF3B3等其他亚基相互作用,稳定复合物结构,确保剪接过程的准确性。SF3B5在多种组织中广泛表达,其功能异常可能影响RNA剪接,进而导致疾病。目前研究表明,SF3B5的突变与某些癌症和发育异常相关,但具体机制仍在研究中。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
骨髓增生异常综合征 SF3B5突变可能影响剪接体功能,导致RNA剪接异常,与MDS的发生相关。 较强研究证据
急性髓系白血病 SF3B5突变在AML中偶有报道,可能参与疾病发生。 潜在关联
慢性淋巴细胞白血病 SF3B5突变在CLL中罕见,但可能与其他剪接因子突变协同作用。 潜在关联
黑色素瘤 SF3B5突变在黑色素瘤中被发现,可能影响剪接调控。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
骨髓 暂无可靠数据 暂无可靠数据
外周血 暂无可靠数据 暂无可靠数据
脾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
淋巴结 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
K562 暂无可靠数据 慢性粒细胞白血病细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.433A>G (p.Thr145Ala) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性或相互作用
c.494C>T (p.Pro165Leu) 错义突变 罕见 可能影响剪接体功能
c.556G>A (p.Gly186Arg) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变:导致SF3B5蛋白功能丧失或减弱,可能影响剪接体组装或活性,导致剪接异常。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:目前尚无明确证据表明SF3B5存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:可能通过干扰SF3b复合物正常功能,产生显性负效应,但具体证据不足。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005681 • GO:0000398
• GO:0000245 • GO:0005634

相关通路

hsa03040
R-HSA-72163

蛋白质功能简介

SF3B5蛋白是剪接体SF3b复合物的一个亚基,该复合物是U2 snRNP的核心组成部分。SF3B5蛋白含有约100个氨基酸,分子量约为10 kDa。它通过与SF3B1、SF3B3等亚基相互作用,稳定复合物结构,并在pre-mRNA剪接的早期步骤中识别分支点序列。SF3B5在多种组织中表达,其表达水平可能受到细胞周期和发育阶段的调控。研究表明,SF3B5的突变可能影响剪接体的正常功能,导致RNA剪接异常,进而参与疾病的发生发展。

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