SFRP1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SFRP1编码分泌型卷曲相关蛋白1,作为Wnt信号通路的负调控因子,在多种癌症中发挥抑癌作用。
基因信息卡
| 基因符号 | SFRP1 |
|---|---|
| 基因全名 | secreted frizzled related protein 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 8p11.21 |
| NCBI Gene ID | 6422 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6422 |
| Ensembl ID | ENSG00000104332 |
| UniProt ID | Q8N474 |
| OMIM ID | 604156 |
| HGNC ID | 10776 |
| 基因别名 | FRP, FRP1, FrzA, SARP2 |
基因功能与研究简介
SFRP1(secreted frizzled related protein 1)编码分泌型卷曲相关蛋白1,属于SFRP家族。该蛋白含有与Frizzled受体相似的富含半胱氨酸结构域(CRD),能够结合Wnt配体并拮抗Wnt信号通路的激活。SFRP1在多种组织中表达,参与细胞增殖、分化、凋亡和迁移等过程的调控。在多种癌症中,SFRP1启动子区常发生高甲基化导致表达沉默,从而解除对Wnt信号的抑制,促进肿瘤发生发展。因此,SFRP1被认为是一种潜在的抑癌基因。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 结直肠癌 | SFRP1启动子高甲基化导致表达沉默,激活Wnt信号通路,促进肿瘤发生 | 已明确致病 |
| 乳腺癌 | SFRP1表达下调与不良预后相关,可能通过激活Wnt信号促进肿瘤进展 | 具有较强研究证据 |
| 胃癌 | SFRP1甲基化与肿瘤分期和淋巴结转移相关 | 具有较强研究证据 |
| 肺癌 | SFRP1表达降低与肿瘤侵袭性增加有关 | 潜在关联 |
| 肝细胞癌 | SFRP1甲基化导致表达沉默,激活Wnt信号通路 | 具有较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| 启动子甲基化 | 表观遗传改变 | 常见 | 导致基因沉默,功能丧失 |
| c.313C>T (p.Arg105*) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,功能丧失 |
| c.421A>G (p.Ile141Val) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,但证据有限 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
SFRP1功能丧失突变(如无义突变、启动子甲基化)导致Wnt信号通路过度激活,促进肿瘤发生。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明SFRP1存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明SFRP1存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005109 (frizzled binding) | • GO:0005576 (extracellular region) |
| • GO:0007165 (signal transduction) | • GO:0016055 (Wnt signaling pathway) |
| • GO:0008284 (positive regulation of cell population proliferation) | • GO:0008285 (negative regulation of cell population proliferation) |
相关通路
• Wnt signaling pathway (P00057)
• Hippo signaling pathway (P00053)
• Pathways in cancer (hsa05200)
蛋白质功能简介
SFRP1蛋白是一种分泌型糖蛋白,含有信号肽、一个富含半胱氨酸的结构域(CRD)和一个C端结构域。CRD结构域与Frizzled受体的配体结合域高度同源,能够直接结合Wnt配体,从而阻断Wnt与Frizzled受体的结合,抑制经典和非经典Wnt信号通路。SFRP1在胚胎发育、组织稳态和肿瘤抑制中发挥重要作用。