SFSWAP基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SFSWAP(剪接因子SWAP同源物)参与RNA剪接调控,与多种癌症及发育异常相关。

基因信息卡

基因符号 SFSWAP
基因全名 splicing factor SWAP homolog
基因类型 protein-coding
染色体位置 12q24.31
NCBI Gene ID 22984 ncbi.nlm.nih.gov/gene/22984
Ensembl ID ENSG00000110931
UniProt ID Q12872
OMIM ID 603270
HGNC ID 10791
基因别名 SFRS8, SWAP, SFSWAP, FLJ31438

基因功能与研究简介

SFSWAP基因编码剪接因子SWAP同源物,属于SR蛋白家族,参与前体mRNA的剪接调控。该蛋白在多种组织中表达,尤其在脑和睾丸中高表达。SFSWAP通过调控RNA剪接影响基因表达,与多种疾病相关,包括癌症和发育异常。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 SFSWAP异常表达与多种癌症相关,可能通过调控剪接影响肿瘤相关基因表达。 较强研究证据
发育异常 SFSWAP在胚胎发育中发挥作用,突变可能导致发育异常。 潜在关联
神经系统疾病 SFSWAP在脑组织中高表达,可能参与神经发育和功能。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
K562 暂无可靠数据 白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Thr412Ala) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.567del (p.Gly190ValfsTer23) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,可能丧失功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

移码突变导致蛋白截短,可能丧失剪接调控功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003729 (mRNA binding) • GO:0006397 (mRNA processing)
• GO:0008380 (RNA splicing) • GO:0005634 (nucleus)

相关通路

hsa03040 (Spliceosome)
hsa05034 (Huntington's disease)

蛋白质功能简介

SFSWAP蛋白属于SR蛋白家族,含有RNA识别基序和富含精氨酸/丝氨酸的结构域,参与前体mRNA的剪接。该蛋白在细胞核中定位,与剪接体组分相互作用,调控基因表达。

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