SH3PXD2A基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SH3PXD2A编码的Tks5蛋白是细胞迁移和侵袭的关键调控因子,在癌症进展中发挥重要作用。
基因信息卡
| 基因符号 | SH3PXD2A |
|---|---|
| 基因全名 | SH3 domain containing polyproline rich protein 2A |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 10q24.33 |
| NCBI Gene ID | 9644 ncbi.nlm.nih.gov/gene/9644 |
| Ensembl ID | ENSG00000107960 |
| UniProt ID | Q5T0N5 |
| OMIM ID | 608887 |
| HGNC ID | 19223 |
| 基因别名 | SH3MD1, TKS5, FISH |
基因功能与研究简介
SH3PXD2A基因编码含有SH3结构域和脯氨酸富集区的蛋白Tks5。Tks5是podosome和invadopodia的关键组分,参与细胞外基质降解、细胞迁移和侵袭。该蛋白在多种癌细胞中高表达,与肿瘤侵袭和转移密切相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症(多种类型) | SH3PXD2A在多种癌症中高表达,促进肿瘤细胞侵袭和转移。 | 较强研究证据 |
| 神经发育障碍 | 有研究表明SH3PXD2A与神经发育相关,但具体机制尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| MDA-MB-231 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系,高表达 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系,高表达 |
| U87 | 暂无可靠数据 | 胶质母细胞瘤细胞系,高表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Lys412Glu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,但具体影响未知 |
| c.567_568insC (p.Leu190ProfsTer23) | 移码突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,可能丧失功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
移码突变导致蛋白截短,可能丧失功能,但缺乏功能验证。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0005886 (plasma membrane) | • GO:0030027 (lamellipodium) |
| • GO:0001725 (stress fiber) | • GO:0003779 (actin binding) |
| • GO:0007155 (cell adhesion) | • GO:0030335 (positive regulation of cell migration) |
| • GO:0001666 (response to hypoxia) |
相关通路
• hsa04670 (Leukocyte transendothelial migration)
• hsa04810 (Regulation of actin cytoskeleton)
• hsa05200 (Pathways in cancer)
蛋白质功能简介
SH3PXD2A编码的Tks5蛋白包含5个SH3结构域和一个PX结构域,定位于细胞质膜和细胞质中。Tks5是podosome和invadopodia的关键组分,参与细胞外基质降解、细胞迁移和侵袭。该蛋白在多种癌细胞中高表达,与肿瘤侵袭和转移密切相关。