SH3RF1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SH3RF1编码E3泛素连接酶,参与JNK信号通路调控,与神经退行性疾病和癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SH3RF1 |
|---|---|
| 基因全名 | SH3 domain containing ring finger 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 4q32.3 |
| NCBI Gene ID | 57630 ncbi.nlm.nih.gov/gene/57630 |
| Ensembl ID | ENSG00000138685 |
| UniProt ID | Q7Z6J0 |
| OMIM ID | 611247 |
| HGNC ID | 17650 |
| 基因别名 | POSH, RNF142 |
基因功能与研究简介
SH3RF1(SH3 domain containing ring finger 1)编码一种E3泛素连接酶,属于RING finger蛋白家族。该蛋白包含多个SH3结构域和一个RING finger结构域,参与调控JNK信号通路,通过泛素化底物影响细胞凋亡、应激反应和神经元存活。SH3RF1在多种组织中表达,尤其在脑和心脏中丰富。研究表明其功能异常与神经退行性疾病(如帕金森病)、心肌病及多种癌症相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 帕金森病 | SH3RF1突变可能影响其E3连接酶活性,导致底物降解异常,影响神经元存活,增加帕金森病风险。 | 较强研究证据 |
| 心肌病 | SH3RF1在心脏中高表达,可能参与心肌细胞凋亡和应激反应,突变或表达异常与心肌病相关。 | 潜在关联 |
| 癌症 | SH3RF1在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控JNK通路影响肿瘤细胞增殖和凋亡。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚肾细胞系 |
| H9c2 | 暂无可靠数据 | 大鼠心肌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Lys412Glu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性或功能 |
| c.567delC (p.Leu189TrpfsTer5) | 移码突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,可能丧失功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变:导致蛋白表达减少或活性降低,可能影响JNK信号通路调控。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得突变:增强E3连接酶活性,导致底物过度降解,可能促进细胞凋亡。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变:突变蛋白干扰野生型蛋白功能,可能影响信号通路平衡。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) | • GO:0007254 (JNK cascade) |
| • GO:0016567 (protein ubiquitination) |
相关通路
• MAPK signaling pathway (KEGG: hsa04010)
• JNK signaling pathway (Reactome: R-HSA-450282)
蛋白质功能简介
SH3RF1蛋白包含多个SH3结构域和一个RING finger结构域,作为E3泛素连接酶参与底物蛋白的泛素化降解。它通过调控JNK信号通路,影响细胞凋亡、应激反应和神经元存活。在神经系统中,SH3RF1可能通过降解特定底物保护神经元免受应激损伤;在心脏中,它参与心肌细胞凋亡的调控。其功能异常与多种疾病相关。